Auf die Studenten der Duellakademie kommen im neuen Schuljahr viele Veränderungen zu. Neben vier Austauschstudenten, ist auch der mysteriöse und strenge Professor Thelonius Viper neu an der Akademie. Dieser bestimmt die Kontrahenten eines ersten Showduells. Der Gegner von Jaden ist der neue Austauschstudent der Nordakademie Jesse Andersen.
Four Transfer students, and Professor Thelonius Viper, arrive at Duel Academy. Jaden befriends a new student who can also see Duel Spirits. Then when the new students are revealed, one of them, Jesse Anderson, is missing. Then Jaden's new friend shows up last, claiming he got lost on the way to the ceremony, and reveals he is Jesse, who is in possession of a rare deck of "Crystal Beasts". Professor Viper makes Jaden and Jesse duel in an exhibition match.
All'accademia arrivano dei nuovi studenti tra cui: Adrian Gecko, Jim Crocodile Cook, Jesse Andersen, Axel Brodie, il professore Thelonius Viper e infine una vecchia conoscenza, la giovane Blair Flannigan. Inizia così il duello tra Jaden Yuki e Jesse, ovvero un duello tra i mostri Neo-Spaziali e le Bestie Cristallo.
新学期が始まったデュエルアカデミア。ここに学校のチャンピオンである「アモン」「オブライエン」「クロコダイル」と「プロフェッサー・コブラ」と「謎の男」が留学生として招待され、新たな仲間となった。
Jaden conoce al mejor estudiante de la Academia del Norte, Jesse Anderson, un duelista que puede hablar con espíritus de monstruos, ¡al igual que Jaden!
