Heitmann, der Konrektor der Duell-Akademie möchte die Klasse mit den schlechtesten Leistungen der Schule verweisen. Auf einen Vorschlag des Duell-Akademie Direktors, muss sich Yusei anschließend mit Heitmann duellieren.
As Yusei and Crow work on their new engine, they are visited by Leo, Luna and their classmates, including the timid Sly, who is nearly tempted to steal Stardust Dragon. Yusei is asked by the Academy's principal to fix something, which turns out to be the head instructor, Rudolph Heitmann, who is threatening to expel Leo, Luna, and their friends for using low level monsters. Yusei arrives, and challenges Heitmann to a duel, in order to stop them getting expelled, and to prove the strength of low level monsters. Heitmann manages to summon three Ancient Gear Golems on his first turn and deals a lot of damage. Yusei summons out Stardust Dragon, but sacrifices him to summon out several Tuner monsters, which belong to the relevant students. Yusei manages to use them to defeat Heitmann, who learns his lesson, and withdraws the expulsions. As Yusei leaves, Sly contemplates to steal Stardust Dragon. Fortunately, he will never get that chance.
Alors que Yusei, Jack et Crow travaillent sur leur nouveau moteur, Lua, Luca et leurs camarades de classe viennent les visiter. Le principal de la Duel Académie demande à Yusei de réparer quelque chose : faire entendre raison au professeur à la tête de l'académie. Celui-ci menace d'expulser Lua, Luca et leurs camarades de classe de la Duel Académie car ils utilisent des monstres de niveau faible. Yusei arrive et défi le prof. Heitmann en duel afin d'empêcher leurs expulsions et afin de lui prouver la force des monstres de niveau faible. Yusei invoque le Dragon Poussière d'Étoile, mais le sacrifie pour invoquer plusieurs monstres Syntoniseurs, qui appartiennent aux élèves qui lui ont donné leur carte avant le duel. Yusei arrive à les utiliser pour battre Heitmann, qui apprend une bonne leçon sur la force des cartes et décide alors de ne pas expulser Lua, Luca et leurs amis.
ゴーストとの激しいデュエルの結果、機皇帝ワイゼルを殲滅した遊星。ゴーストの元に駆け寄ると、そこにはセキュリティが開発中のライディングロイド、すなわちDホイールの違反を取り締まるロボットの姿があった。
数日後、遊星の前にひとりの老人が現れる。老人が言うには、ちょいとネジを締め直してほしいものがある、という。訝る遊星であったが老人の頼みを引き受けることに。果たして、老人の言う「ネジを締め直してほしいもの」とは・・・・・・?