Der gigantische Mutant Apocalypse glaubt den Auftrag zu haben, die Menschen für ihre Bosheit zu strafen und sie in bestimmten Zeiträumen mit Plagen wie Pest, Kriegen oder Naturkatastrophen zu überziehen. Apocalypse lebt in den Pyramiden, wo er für seine nächsten Attacken neue Kräfte schöpft – und nur Cable und dessen Sohn Tyler ahnen, wann es wieder so weit sein wird.
In 3999 Apocalypse tricks Cable and steals Cable's time device.
Nel 3999, Apocalisse inganna Cable, rubandogli il dispositivo del tempo.
Apocalipsis roba la computadora de Cable en el año 3999, lo que le permite viajar en el tiempo al pasado, donde planea poner fin a su lucha contra mutantes inferiores de una vez por todas. Esto lleva a que Bishop quede atrapado en medio de la corriente temporal, y trae
3999 год. Бицепс находит лазарет Апокалипсиса и хочет его уничтожить, однако Апокалипсис предвидел нападение и во время битвы отбирает временной телепорт у Бицепса и исчезает. Но в этот момент Квакер также возвращается в 2055 год из 1959, и в результате оба оказываются на оси времени. Квакер будучи на оси времени, встречается с Бендером - весельчаком и балагуром, также являющимся создателем оси времени. Тем временем в 1990-х Джина и Скотт играют свадьбу, но не успев отъехать далеко на них нападают слуги Злыдня и похищают Джину, а сам Злыдень пытается похитить профессора но Джубили и прибывшая Шарда (сестра Квакера) а затем и остальные Люди Икс срывают его попытку.
Em 3999, Apocalipse derrota Cable e rouba-lhe o computador que permite viajar no tempo. Bem no dia da segunda tentativa de casamento de Jean e Scott, Sr. Sinistro e os Nasty Boys sequestram a noiva. Enquanto isso, Bishop fica preso numa fenda temporal. Sua irmã, Shard, vai em seu socorro mas vai parar na Mansão X.
