Starscream is now in charge of the Decepticons, but all he does is lead them to defeat in battle against the Autobots. But things are about to get much worse when Megatron returns, setting his sights on a new and powerful anti-matter formula.
Les Décepticans, maintenant dirigés par Starscream, continuent à attaquer des objectifs sur la Terre, mais sont facilement contrecarrés par les Autobots. Optimus Prime envoie Prowl et Bluestreak contre les forces d'assaut des Décepticans, mais ceux-ci ne sont pas de taille à lutter contre une armée entière. Un Mégatron bien vivant prend contact avec les Décepticans restés sur terre et revient par le pont spatial. Entretemps, Bumblebee, Spike et leur ami Chip Chase, un champion de l'informatique cloué à son fauteuil roulant, sont mis au courant d'un projet humain de mise au point d'une formule d'anti-matière. Une copie de secours est confiée à Chip pour sauvegarde. A la maison, Chip reçoit un appel de détresse de Prowl et assure son contrôle, ce qui lui permet, à lui et à Bluestreak, de triompher des Décepticans qu'ils ont découverts. Mégatron et les Décepticans tentent de voler la formule anti-matière, mais Chip parvient à l'effacer de son ordinateur. Mégatron réussit vite à obtenir du scientifique l'endroit où se trouve la copie de secours, et les Décepticans s'emparent de l'enceinte du projet de fabrication d'anti-matière où ils retiennent Chip en otage. Hound et Mirage, à l'aide de leurs capacités exceptionnelles, s'arrangent pour infiltrer l'enceinte et pour faire sortir Chip. Les Autobots attaquent, mais Mégatron armé de l'anti-matière est trop puissant. Finalement, l'anti-matière devient trop instable et Mégatron doit s'en débarrasser.
Starscream ahora está a cargo de los Decepticons, pero todo lo que hace es llevarlos a la derrota en la batalla contra los Autobots. Pero las cosas están a punto de empeorar cuando Megatron regresa, poniendo su mirada en una nueva y poderosa fórmula anti-materia.
斯派克的朋友切普是个残疾的电脑天才，他意外地被卷进了汽车人和霸天虎间的一场斗争里，因为他知道霸天虎想要的一种秘密能量的配方，而在家中遭到绑架。
デストロンが狙う反物質の製法を託されたのは、スパイクの親友で車椅子の天才少年チップだった。図らずも戻った故郷から、再び帰還したメガトロンはチップを拉致し、逆に反物質を我が物にしてしまう。
Мегатрон благополучно возвращается на Землю (к большому разочарованию Скандалиста, уже успевшего провозгласить себя новым лидером десептиконов) и организует нападение на секретную лабораторию, в которой получена формула антиматерии. Но доктор Альказар, руководитель лаборатории, успел стереть заветную формулу из памяти компьютера, и теперь её тайной владеет только один человек — юный «компьютерный гений» Чип Чейз…
