超効率厨の高校生・大星明照の部屋には、なぜか友達の妹・小日向彩羽が入り浸っている。学校では清楚な美少女優等生、しかし明照にだけやたらとウザ絡みしてくる彩羽。そんな彼女とウザくも賑やかな日常を送る明照のもとに、従姉妹の月ノ森真白が突然現れ――!?
真白との一件を彩羽に言えない明照が彩羽に全力で怪しまれまくるなか――真白が香西高校にやってきた！ 転校早々真白が投下した爆弾発言により、明照のクラスは大混乱。さらに明照は、誰もが恐れる毒舌教師こと“猛毒の女王”影石菫に呼び出されてしまい――。
真白の心を開くため、明照は彩羽や菫、親友の小日向乙馬の協力を得て、真白の歓迎会を開くことに！しかし明照渾身の勧誘は、真白の容赦ない塩対応の前に連戦連敗。撃沈続きに密かに焦りながらも、明照は迫る歓迎会の準備を彩羽とともに進めるのだが――。
「友達の妹って他人ですよね？」明照がまだ“センパイ”ではなく、彩羽がまだ“友達の妹”ですらなかった頃。中学時代の明照、乙馬、彩羽、そして――。明かされる過去！ これは、彩羽がまだ誰にもウザくなかった頃の物語。
「はい、よろしくお願いしますね、大星先輩」中学時代、親友のために始めたゲーム作り。そこで、まだ極度の効率厨ではなかった明照は、小日向彩羽という才能と出会った。『５階同盟』誕生秘話！ これは、彼女が彼にだけウザくなるまでの物語。
彩羽＆真白とショッピングモールにやってきた明照。 両手に花のハーレム状態を彩羽にイジられたり、どの映画を見るかで軽く揉めたりしつつも、なんやかんやで盛り上がる３人。 しかしそこに、真白のトラウマの元凶であるかつての同級生たちが現れて……。
真白の突然の告白から、明けて翌朝。 明照は突然の出来事に混乱しながらも、真白への気持ちを固めていた。 自分のこの気持ちを真摯に伝えよう。しかし、いざ登校してみると、 真白の態度は明照に対して超絶塩対応のまま……どころかなぜか悪化していて――!?
体調不良で倒れた明照は、彩羽にかいがいしく看病される。 明照はウザ絡みゼロの清楚な看病に感謝しつつ、彩羽の態度に違和感を覚えてしまう。 真白に続き、彩羽まで様子がおかしい。 そんななか明照は菫から、菫の妹・影石翠率いる演劇部の再建を依頼され――？
友達の妹がウザくなくなった!? 普段のウザ絡み攻撃に慣れきっていた明照は、 急におしとやか清楚キャラになった彩羽に激しく動揺してしまう。 そして、明照と彩羽が噛み合わないなか、スタジオ収録中のとあるすれ違いから、 ２人は大ゲンカをしてしまい――？
乙馬の協力のもと、夜の小日向家に突入した明照。 その目的は一つ、彩羽と和解すること！ いくら呼びかけても部屋から出てこない彩羽相手に明照が選択した、 最も効率のいい手段、それは――。 友達の妹を再びウザくするための明照の戦いが、いま始まる！
