Während des Vietnamkrieges verschwindet ein junger Offizier spurlos von dem USS Cacapon Stützpunkt auf den Philippinen. Die Ermittler der NCIS versuchen das Rätsel zu lösen, das aus widersprüchlichen Aussagen der Tatverdächtigen und gestohlenem Geld besteht. Um den Fall zu lösen, muss die NCIS aufdecken, wer alles in dem grausamen Mord verwickelt war.