Skipper ist auf einer Streng Geheimen Mission ganz alleine in Shanghai unterwegs.
Dort tapt er in eine Falle von Lars und verliert dabei sein Gedächtnis, irritiert wacht er Später auf einer einsamen Insel auf.
Dr. Seltsam ,der mit Lars unter einer Decke steckt, hat in der Zwischenzeit das Pinguinhauptquatier geortet...
Dr. Blowhole, the penguins' evil dolphin nemesis, returns to New York with a diabolical plan to turn them into creatures of destruction.
Akcja dzieje się pół roku po wydarzeniach z odcinka Zemsta doktora Bulgota. Skipper rusza na samotną misję do Szanghaju. Tam zostaje zaskoczony przez Hansa i Dr. Bulgota, który za pomocą nowego wynalazku wysysa mu pamięć. Pingwin wpada do morza i zostaje wyrzucony na bezludną wyspę. Tam jego oczom ukazują się trzej "widmowi przewodnicy", którzy mają przywrócić mu pamięć, a byli to: Buck Rockgut, Generał Xin-Jin i lew Alex (wszyscy trzej są w rzeczywistości w zupełnie innych miejscach i pojawiają się tylko ich widma). Ten ostatni postanawia pomóc staremu przyjacielowi w walce z delfinem, który tymczasem atakuje Manhattan. Przypadkowo jednak tworzy zmutowane MP3 zmuszające wszystkich do śpiewu.
Doutor Narina, o malvado golfinho nêmesis dos pinguins, retorna a Nova York com um plano diabólico de transformá-los em criaturas de destruição.
Доктор Блоухол, злой враг пингвинов среди дельфинов, возвращается в Нью-Йорк с дьявольским планом превратить их в существ, сеющих разрушение.
