Prezident Martinez znovu přebírá kontrolu po Thomasově útoku na Inostranku. Michael nechá Leilu u přítele a vydává se za Thomasem. NSA pracuje na rozšifrovávání zprávy vyslané do vesmíru.
Trotz des Überfalls in Kanada kann Präsident Martinez wieder die Oberhand über die außer Kontrolle geratene Situation gewinnen. Mit der Hilfe von Sterling und Richard hält sich der politische Schaden in Grenzen, den die Flucht der Inhaftierten von Inostranka ausgelöst hat. Allerdings setzt Thomas‘ Plan seine Mutter Sophia und Präsident Elias Martinez weiter unter Druck. Außerdem hat Thomas eine Antwort von seinem Volk auf dem Heimatplaneten erhalten. Er ruft seine Mutter Sophia, Diana Geller und die anderen Schläfer zusammen, um ihnen die richtungsweisende Botschaft zu verkünden.
President Martinez gets tougher with dealing with the cleanup of Thomas's breakout of 51 Inostranka detainees. Michael drops Lelia and Samantha off with a fellow alien family to go help Sophia stop Thomas. The 51 detainees and Thomas move into a suburban area, while Michael and Sophia detain one of them for questioning. Sean gets into a bar fight.
Sophia kuulee Thomasin teloittaneen kaikki hänelle uskolliset muukalaiset ja aikovan varastaa lastin uraania toteuttaakseen suunnitelmansa. Hän varoittaa presidentti Martinezia, mutta tällä on vaikeuksia luottaa Sophiaan kaiken tapahtuneen jälkeen. Simon joutuu väijytykseen.
Le président Martinez a plus de mal avec l'évasion de Thomas et des 51 détenus d'Inostranka. Michael laisse Lélia et Samantha avec une famille pour aller aider Sophia à arrêter Thomas. Les 51 détenus et Thomas se déplacent dans une zone de banlieue, tandis que Michael et Sophia an appréhende un pour l'interroger. Sean se bat dans un bar.
Sterling e Richard aiutano il presidente a tenere a bada le conseguenze politiche della fuga da Inostranka. Intanto Michael si unisce alla ricerca di Thomas, lasciando Leila con una vecchia amica, Diane Geller.
София узнаёт, что Томас собирается украсть уран, чтобы использовать его как топливо для портала. Она предупреждает об этом президента, и тот решает перевезти уран в безопасное место. Но оказывается, что всё это было тщательно продуманным планом Томаса, и конвой, перевозящий уран, попадает в засаду. Шон решает выяснить, кто стоял за похищением девочек, и отправляется к Вики.
Sterling och Richard rusar för att hjälpa president Martinez att ta kontroll över den politiska följden av fångarnas flykt från Inostranka. Under tiden går Mikael på jakt efter Thomas medan Leila tar hand om en gammal vän, Diane Geller.