Scott und Stiles retten das Rudel vor Kate.
Scott and Stiles return to La Iglesia to save the Pack from Kate.
La meute et les amis de Scott partent au Mexique, pour sauver le vrai Alpha et sa petite-amie, Kira. Une bataille mortelle s'engage contre Kate et ses Berserkers. Kate fait part de certaines choses à Kira avant que la bataille ne commence. Derek est mortellement blessé et meurt. Braeden et ses alliés affrontent les Berserkers, jusqu'à ce que Kira explique que l'un d'eux est Scott, transformé. Liam réussit à raisonner Scott, qui redevient un loup-garou Alpha. Peter, prêt à tuer Scott, l'affronte. Il finit par être mis KO et de l'aconit jaune lui est injecté, jusqu'au retour à Beacon Hills.
Les Calaveras aident la meute de Scott à affronter Kate. Celle-ci est blessée par Derek, qui a évolué en loup noir aux yeux bleus, très puissant. Sa transformation complète a nécessité une perte de ses pouvoirs mais désormais, il est fort et totalement loup. Kate est poursuivie par Chris, qui refuse de la tuer car celle-ci l'a amadoué avec la mort d'Allison puis finit par s'enfuir. Braeden explique à Derek qu'elle a dû traquer la Louve du Désert - la mère de Malia - mais n'a jamais réussi à la trouver.
Pendant ce temps, Lydia, le shérif et Mason affrontent un Berserker au lycée. Le shérif lui donne une claymore, qui détruit le Berserker. Lydia finit par aller voir Parrish et lui donner le Bestiaire, promettant qu'elle va l'aider à trouver ce qu'il est. Quand tout est terminé, tout le monde rentre à Beacon Hills, sauf Chris et les Calaveras, qui vont traquer Kate au Mexique.
En parallèle, Peter, qui est enfermé à Eichen House avec le Dr Vallack est effrayé par son apparence, hurle à la mort en tapant contre la vitre de sa cellule, faite de verre et de bois de sorbier.
בפרק האחרון לעונה, סטיילס אוסף את כולם כדי לנסוע למקסיקו להציל את סקוט וקירה. גם פיטר מציע את עזרתו במלחמה בברזרקרים. לידיה הלכה לביה"ס כדי לקחת משהו שנושא את הריח של קירה, אבל נתקעה שם.
Scott e Kira sono nelle mani di Kate che intende trasformare Scott in un Beserker. Peter, Stiles, Derek, Malia, Liam e Braeden si organizzano per andare a salvarlo. Lydia intanto è rimasta bloccata con Mason a scuola e sono in fuga da un Beserker. Appena arrivati Derek viene ferito gravemente e mentre Braeden rimane con lui per proteggerlo, gli altri vanno a cercare Scott, solo per scoprire che il processo di conversione è già concluso. Allo scontro si uniscono anche i Calaveras e quando tutto sembra perduto, Liam riesce a rianimare Scott, mentre Derek risorge dalle sue ferite, trasformandosi in un lupo nero che attacca Kate senza pietà. Scott capisce che Peter stava lavorando con Kate e i due si affrontano finalmente in battaglia.
Scott e Kira são raptados por Kate e levados para o México, e para salvar seus amigos das garras de Kate, Stiles, Lydia, Liam, Derek e Brendan precisam retornar a La Iglesia.
Scott causa destrozos en La Iglesia. Cuando llega la manada, lo ayudan a liberarse del hechizo de Kate.
Kate promění Scotta v muže z kostí a zcela ho ovládne. Ostatní se ho snaží zachránit. Jediná Lydie, která ví o Scottovi, je uvězněna ve škole, takže nemůže ostatní varovat. Liam se musí vypořádat s úplňkem.