Chris tritt Division 2 endlich bei, und sie bringt wertvolle Informationen mit, nämlich den Namen des Projekts, an dem Phine arbeitet. Doch bevor die Mädchen die Pläne vereiteln können, tauchen vier riesige Noise am Himmel über Tokyo auf.
Ryoko is attacked by some American terrorists while hacking information off on Finé's computer, but she kills them using Black Arts, though takes some damage in doing so. As Chris and Genjuro come across the scene, Genjuro helps Chris understand what her parents fought for. As the Second Division investigates a clue given to them by Chris, Kadingir, a group of large airborne Noise appears over Tokyo Sky Tower, with Chris arriving to assist Hibiki and Tsubasa. Despite some hostility from Chris, Hibiki helps her and Tsubasa get along and together they defeat the Noise. Afterwards, however, Hibiki receives a distressing call from Miku that the academy is under Noise attack.
Chris dit à Genjûrô qu'elle a entendu que Kadingir était complète. La deuxième division des affaires spéciales doit se renseigner pour savoir comment répliquer, quand une attaque de Noise volants menace la ville.
叛意をうかがわせるフィーネより、聖遺物研究データを奪取せんとアジトを強襲する米国特殊部隊。そこには、いるはずのない櫻井了子の姿があった。
撃ち抜かれ、血溜まりに呻く了子。
だが、その掌にかざした青い燐光が銃創をたちどころに塞いでいく。
超常の光景に向かって、銃爪を引く特殊部隊員。
了子の身体は、無残にも鉛玉に引き裂かれていくのであったが……
フィーネとの決着をつけるべく、単身アジトに乗り込んできたクリスの眼前に横たわるのは、特殊部隊員たちの屍のみ。
深淵に潜んでいた陰謀は、ついに全貌を現そうとしていた。