Dealing with Shadow's anger, Eggman switches places with his counterpart from the dimension where Sonic doesn't exist. Now Sonic must deal with both Eggman, plus Shadow and Metal Sonic before the two dimensions collapse.
Affrontando la rabbia di Shadow, Eggman fa a cambio con la sua controparte della dimensione in cui Sonic non esiste. Ora Sonic deve affrontare sia Eggman che Shadow e Metal Sonic prima che le due dimensioni crollino.
Quando Dr. Eggman foge para outra dimensão após uma revelação, Sonic deve localizá-lo antes que um desequilíbrio cósmico destrua o mundo.