「ニトロを仕掛けた」と西部署に予告。指定されたトラックが爆発し警官2名が殉職。次のバスは走行中に運転手が射殺され暴走。そこを新戦力の沖田刑事が、併走するトラックからドアを蹴破って飛び込み停車。しかし次の予告のバスは乗客14名が犠牲に・・・。 犯人の立花は部下に客船をジャックさせ、乗客300名の命と引替に銀行から20億の大金を奪い、羽田空港から香港へ高飛びしようとします。客船はヘリで沖田が発見、ジョーと共に部下を仕留め、ニトロ瓶は海中へ投棄。計画が失敗して逆上した立花は大門が射殺。 第1話にして、死傷者数も犯人の要求金額もケタ違いです。PartⅠとの共通点は事件解決後に署内で酒を飲むシーンくらいでしょうか。大門の妹のアコが保母として登場。転職したかのような台詞、大門を「兄貴」と呼ぶなど、それほど違和感はありません。
3人組の銀行強盗が、10億円余りを奪って逃走。しかし、そのうちの1人が被弾した。犯人らは病院へ立てこもり、医師に手術を強要。大門は、沖田や鳩村らに強行作戦を指示するが失敗してしまう。
平尾と北条が撃たれた。大門は、全員で拳銃の行方を追えと指示。だが沖田は命令を無視し、単独で行動する。そして、カギを握っていると見られる死刑囚・吉田に会うが、沖田は激情に駆られ、拳銃を発射してしまう。
北条刑事は捜査ミスにより、大門軍団の中で浮いた存在となった。そんな中、大学教授の石川が射殺され、大門も命を狙われる。これは大門への復讐に燃える黒部が、石川教授の研究を悪用しての仕業だった。
死刑囚の蛭川卓次と満兄弟が脱獄。その頃、交番爆破事件が発生し、犯人は、蛭川兄弟と親密な手塚と判明する。手塚は、警視総監の孫を誘拐し、見せしめで交番を爆破したのだった。手塚は結局捕まえられるが…。
病院のボイラーマン・田村が殺害されたが、北条刑事は付き合い始めた有紀とのデートで捜査に穴を空けてしまう。大門は、田村らが病院のヘロインを盗み出していたことから、背後に密売組織が存在するとにらみ…。
大門が5年前に捕まえた暴力団員・八神が、爆弾魔・望月と組み、再び大門に挑戦してきた。しかも望月の爆弾は、音がある一定の大きさになると爆発するという仕掛けだ。八神はこの爆弾を、ベビーホテルに仕掛け…。
防衛隊が廃棄処分予定だったライフル100丁が、強奪された。大門は、元モデルガン工場の工員・京田明を割り出す。京田は、自分の過失によって失明した恋人の手術費を作るため、奪われたライフルを修理していた。
平尾刑事は捜査中、突然殴られ、気が付くと目の前に死体が転がっていた。平尾には殺人と、ヘロイン購入の疑いが掛けられてしまう。死体は神部という男で、平尾がおとりにして密売グループを探らせていた男だった。
M16ライフルを使用した強盗事件が続発したことで、大門らはM16密売組織壊滅に全力を挙げていた。容疑者が次々に浮かび上がり、密売拠点も静岡であることが判明。大門軍団は全員で静岡へ向かう。
大門軍団は密輸組織を追い詰めたが、M16は不動産屋・山根らの手で奪われてしまう。さらに山根の背後には、金の密輸を手掛けていた杉森が控えていることが判明。そんな中、10トンの金塊が杉森らに強奪される。
荒井玉青[2] 、深江章喜、石橋雅男、流健二郎、早川研吉、曽我佐和子、福島麻矢、滝義郎、三重街恒二、小池幸次、山田博行、大竹義夫、澤田洋、大屋隆俊、麿のぼる、高橋雅男、浅野直人、渡辺文武
浜刑事が手掛けた10年前の強盗事件の犯人・安井が生きていたことが判明。安井は強盗事件で宝石を独占し、さらに妻を殺した暴力団元幹部にも次々と復讐をする。ところが、その安井と浜は、戦友同士で…。
10年前の強盗犯・笠松が、鉄砲店から散弾銃と実弾を奪って逃走。二宮は単独で笠松を追い始める。二宮は、かつて捕り逃がした笠松を自分の手で捕まえ、その上で刑事生活を終えようと思っていたのだった。
暴走するダンプカーから2億もの偽札が発見された。また偽札の特徴から、前科者・岩田、室谷が浮上するが、2人とも殺されてしまう。やがて海老原こと揚竜光という香港マフィアの大物の存在が浮かび上がり…。
西部署管内で覚醒剤と拳銃による事件が相次いで、売人として松本が浮上するのだが、その身柄は城北署の服部刑事に押さえられてしまう。その後、松本は釈放されるのだが、ひき逃げにより死亡する。
平尾刑事が、防衛隊で同期の友人の子・健一と共に何者かに誘拐された。平尾は、梅津と柏木という2人の男に脅され、防衛隊訓練所から銃の強奪を手伝わされる。だが、その後柏木は平尾を救うために梅津を殺し…。
暴力団員・浅倉純司が、現金輸送車を襲い5000万円を強奪。そんな中、広島で井上という爆弾魔が殺され、体内から浅倉の拳銃弾が出てくる。大門軍団は広島へ乗り込むが、浅倉は市電に爆弾を仕掛けるのだった。
雑貨商・大曽根を追った3人の男がマシンガンを発射し、買い物客を死傷させる事件が発生。犯人の自供で、大曽根は10キロのヘロインを持っていることが判明した。そして大門軍団は、大曽根を追って広島へ向かう。
密売組織によってヘロイン中毒者が次々と殺されていった。そんな中、沖田刑事が赤塚という容疑者を銃撃戦の末、射殺。だが赤塚は拳銃もヘロインも持っていない。沖田は人殺し刑事のレッテルを貼られてしまう。
鳩村が指揮する特機隊は、事故が多いという理由で本庁から解散の通告を受ける。そんな中、ライダー強盗団が、鉄砲店から散弾銃や銃弾を強奪。一味をオートバイで追った鳩村は転倒してしまい、傷を負う。
拳銃3丁が、元強盗犯・大津の手に渡ったと知った大門らに緊張が走る。また大津は仲間と、大学の研究所からコレラ菌を盗み、理事長の娘・礼子を誘拐。彼女に菌を感染させ、5億円を要求してきた。
黒こげとなった死体が発見され、被害女性は金髪であることが判明。折しもヤクザが、アメリカから偽造パスポートで日本へ踊り子らを送り込んでいるとの情報が入る。やがて竹内というチンピラの存在が浮上し…。
4人組のロックグループが、ルポライター・横山を射殺した犯人を目撃。その4人は犯人に狙われたが、平尾刑事に助けられる。事件の原因は、来日予定のアメリカ上院議員暗殺計画を横山がキャッチしたためと判明した。
西部署に爆破予告電話が何度もあり、現実となってしまう。犯人の1人は西部署のマシンRSの収得を迫り、従わなければ、ホテルを爆破するという。仕方なしにRSを引き渡すことになったのだが…。
札幌の豊平川から、塩酸エフェドリンを検出。大門は覚醒剤の密造工場があるとにらみ北海道へ飛ぶ。水質研究所所長・林はサケが豊平川に帰って来るのを望んでいたが、息子の栄治は、一連の覚醒剤事件に絡んでいて…。
ヘロインの取り引きについて、西部署に若い女から密告電話が入った。大門は全員を現場に急行させるが、一味に気付かれ、逃走されてしまう。また、病院でヘロインの在庫数を調べていた沖田刑事はある現場を目撃し…。
乗用車が、ダンプに追突され、運転手が射殺される事件が発生。乗り捨てられたダンプからは、ヘロインが検出された。また工藤という出所したばかりの男が捜査線上に浮かぶが、彼は以前属していた竜神会へ乗り込み…。
西部署に搬入予定だった拳銃20丁が、強奪され、警察官2名が即死。またその拳銃を強奪した犯人も、マンションの一室で射殺される。そして大門軍団は、マンションに残された留守番電話を頼りに北海道へ向かう。
神奈川県警の元刑事・木下が殺害された。かつて木下と一緒にヘロイン密輸組織を追った沖田刑事は、その時に逃した軍司という男を再び追うことになる。すると捜査線上に、軍司の女・順子が浮上してきた。
大門らは、アメリカから送金される1000万ドルの輸送を担当。そんな折、バスジャック事件が起こり、乗っていた北条刑事が人質になる。犯人は現金輸送のルートを知ろうとして、北条の乗るバスを狙っていたのだ。
浜刑事の娘の友人で、モデルのはるみが爆弾で狙われた。犯人は爆弾魔の辰巳と判明する。ところが、その辰巳と情婦は殺されてしまう。また情婦の持っていた貯金通帳から佐泊という弁護士が浮上し…。
殺害された探偵・工藤は、15年前警察官を殺して強盗を働いた河辺の写真を銀行の貸金庫に隠していた。大門は河辺が工藤を殺したと判断。だが、工藤の体内から摘出された弾丸と、鑑識課員の国立の姿が消える。
宝石店社長の娘・永松洋子が誘拐されたが彼女は腎不全患者で、早期に救出しないと命が危ない。犯人からの連絡で、北条刑事が現金を持って指定の喫茶店に行くと、銃を持ったシャブ中毒の男が飛び込んできて…。
警察官が殺される事件が続発。浜刑事が捜査を始めるが、さらにまた警官が狙撃される。浜は、元警官がホシと考え、塚本という男に突き当たる。塚本は、同僚の報告が原因で懲戒免職になっていたのだ。
新任の南が赴任する日、護送車が襲われ、ライフル魔の矢吹が奪還される。南刑事と平尾は、一味の1人を逮捕したが、矢吹ともう1人の襲撃犯は脱出してしまう。木暮と大門は、矢吹を何者かが利用しているとにらみ…。
宝石強盗の半沢が捕まるが、西部署に「半沢を釈放しろ」と脅迫電話が入る。背後には名古屋の宝石ブローカーがいるようだ。軍団は名古屋へ向かうが、「半沢を長島温泉へ連れてこい」との電話が入り…。
偽札が出回り、作成されたモンタージュ写真の男を追って鳩村刑事は名古屋へ飛ぶ。だが、モンタージュ写真の男の娘が、犯人一味に殺されてしまう。その後、幼なじみの清水洋子と再会した鳩村だったが…。
アルメニヤ国籍のローラ三宅が、誘拐されそうになる。彼女は、生物学者で、偶然貴重なウイルスを発見したことで、某国のスパイに研究資料を狙われていた。大門は、彼女の誘拐をくわだてる一味をあぶり出そうとする。
エリートクラスの息子たち3人が次々に自殺してしまう。やがて、3人とも同じサラ金から金を借りていることが判明した。このサラ金は、解散した暴力団の幹部が経営していることが分かったのだが…。