The aliens strike in full force, and the desperate battle for the planet Earth reaches the very streets of Macross City. Human courage and skill are tested to the limit, against the superior weapons of the Zentraedi. A heroic rescue attempt (by Rick Hunter, to save Lynn Minmei) turns into a nightmare experience.
Les zentradiens donnent l'assaut à la ville de Macross et Rick qui vient de récupérer Minmei se retrouve encore au milieu des combats. Confronté à un ennemi, il est sauvé in extremis par Roy. Pendant ce temps, le SDF décolle malgré un essai infructueux et la réticence du Commandant Gloval.
Los Zentraedi tropas de asalto Isla Macross para capturar el SDF-1, que falla un intento de despegue. Tras ser testigo de la transformación de su avión de combate Veritech, Rick rescata a una niña llamada Lynn Minmei.
二十多艘不明飞船急速接近海岸，格罗佛舰长本想召回福克少校的骷髅中队，但飞行员们正忙于应付第一波攻击。于是他下令普罗米修斯号母舰执行侦察任务。
麦克罗斯城中，瑞克偶然驾驶了一架VF-1D变形战斗机，但由于不熟控制而紧急迫降。战斗机在马路上步履蹒跚，周围的居民都担心是外星入侵者。瑞克无法控制机体，倒向一座民宅，由此邂逅了美丽的少女林明美。
外星战机不断登陆，并造成了重大破坏。卢索参议员要求格罗佛舰长立即起用SDF-1以投入战斗。舰长认为SDF-1仍有许多不解之谜，而且船员都是一些没有太空经验的新手，因而拒绝起飞。但卢索参议员执意要求，于是舰长不得不下令SDF-1升空迎敌。
倒计时开始，SDF-1终于升空，突然船体巨震，原来反重力系统出现了重大故障。SDF-1沉重地坠回原地。
空中迎战的福克通过通讯屏幕向丽莎询问瑞克的情况，丽莎向他指出瑞克造成的破坏比外星人更甚。福克隐瞒了瑞克的身份，并指导瑞克重新控制机体。此时麦克罗斯市开始疏散市民。
天顶星的舰队司令布里泰在近地轨道指挥无数战斗囊登陆海岸，进攻城市。瑞克对战斗机上名目繁多的操纵杆不知所以。明美为取遗忘的日记又跑回市内，途中遭遇外星战斗囊，险象环生，所幸被瑞克所救。战斗中，被瑞克击毁的战斗囊里跳出巨大无比的天顶星人，瑞克被这前所未见的巨人吓得魂不附体。福克解救了瑞克。
SDF-1再次准备升空。在确认市民疏散完毕后丽莎报告说必须放弃麦克罗斯市。堡垒起航，福克招呼瑞克一起返回。但被刚才的可怕景象所震撼的瑞克却没能跟上福克，他和明美一起，滞留在市内入侵者的包围圈中。
