江戸川乱歩の人気作「少年探偵団」シリーズから「妖怪博士」をほぼ原作に忠実に映像化。誘拐された少年団員と機密書類。満島ひかり演じる名探偵・明智小五郎が謎に挑む! 謎の老人を追って洋館に忍び込んだ少年探偵団員。現れた「妖怪博士」は何やら説明のできないような力を持っている様子で、屋敷には恐るべき仕掛けがあった!捜索を依頼された明智小五郎の前に、自らも探偵だと名乗る謎の挑戦者が現れる。明智はライバルに先んじて、少年の身柄と盗み出された機密書類を取り戻すことができるのか?昭和の少年たちを熱狂させた「少年探偵団シリーズ」が、異色のキャスティングと映像美でよみがえる!