One morning, a junior-high student, Kobayashi, wakes up and finds himself in his classroom with his homeroom teacher’s body. In his hand is a murder weapon. A high-school detective, Akechi, is called in to assist the police to solve the case.
コバヤシ少年は学校で目覚めると血に濡れた凶器を握っており、その近くでは担任教師が死体となっていた。コバヤシは重要参考人として新宿警視庁へ任意同行を求められるが、事件現場に赴いていた探偵・アケチの指示によりすぐに釈放される。その後、コバヤシは友人のハシバと共にアケチの事務所を訪れ、アケチの助手に志願するが、この時は断られてしまう。そのころ、元担任の自宅から遺体を加工して作られた人間椅子とコバヤシの指紋が発見され、コバヤシに元担任の共犯者として容疑がかけられ、逮捕状が出される。アケチの通報によりコバヤシはその場に到着した刑事のカガミたちに逮捕される。一方、アケチは「自力で事件を解決し、自分の嫌疑を晴らすことが出来れば、自分の助手に採用してもよい」と提示する。コバヤシはハシバにある指示を出して、新宿警視庁へと向かう。
小林少年在直到升入初中二年级的今天为止，都未曾感到过活着的喜悦。这和死亡没有什么区别。某天，他在变得七零八落的尸体前醒来。那竟然是被杀害的担任教师。小林少年首当其冲被警察怀疑，并被当做嫌疑犯遭到逮捕。由于证据不足而被释放的小林少年，前往拜访了明智侦探。他是年仅17岁就得到政府许可证的少年侦探。今时此地，围绕着神秘的“人间椅子”，小林少年和明智侦探的推理开始了。
Kobayashi se despierta en su salón de clases solo para descubrir el cuerpo desmembrado de su maestro de salón. Siendo el único testigo, y habiendo sido encontrado sosteniendo el arma homicida, se lo ve como el principal sospechoso del asesinato.
Kobayashi, jeune collégien, se réveille dans sa classe à côté du cadavre démembré de son professeur principal. Il est le premier suspect dans l'enquête menée par le commissaire Keisuke Kagami, du département central de police de Shinjuku, et Kogorô Akechi, jeune détective de génie de 17 ans, agréé par l'Agence impériale. Kobayashi ne va pas tarder à demander au dit Akechi d'être son assistant. Ce dernier va lui imposer une condition : prouver son innocence en trouvant le coupable.
