エグリゴリの研究所である教会へ急ぐ涼たちの前に、再びC・Tが立ちふさがる。よりパワーアップしたC・Tの攻撃に、生命と精神の限界に達した涼たちのARMSが更に進化を遂げる。 ARMS「グリフォン」を持つキースが、ジャバウォックを捕らようと鐙沢村へ向かう。 決死の戦いの先に、涼たちはARMSの出生の秘密を知る…！
