| Name | First Aired | Runtime | Image | |
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| S09E01 | エスパーＶＳゴースト！真夜中の決闘!? |
October 6, 2005
TV Tokyo
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| S09E02 | マネネ登場！休息の館！ |
October 13, 2005
TV Tokyo
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| S09E03 | ミズゴロウとモココ！恋の特効薬!? |
October 20, 2005
TV Tokyo
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| S09E04 | バトルアリーナ！格闘対決!! |
October 27, 2005
TV Tokyo
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| S09E05 | そだて屋さんとポケモンのタマゴ！ |
November 3, 2005
TV Tokyo
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| S09E06 | ライバルはサラリーマン!? |
November 10, 2005
TV Tokyo
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| S09E07 | ハクリューの湖！ |
November 17, 2005
TV Tokyo
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| S09E08 | バトルドーム！炎と水のフュージョン!! |
November 24, 2005
TV Tokyo
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| S09E09 | ドッキリ！ビックリ！エレキッド!! |
December 1, 2005
TV Tokyo
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| S09E10 | ポケモンレンジャー登場！セレビィ救出作戦!! |
December 8, 2005
TV Tokyo
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| S09E11 | ウソハチと忍者スクール!! |
December 15, 2005
TV Tokyo
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| S09E12 | 時を超えるハルカ |
December 22, 2005
TV Tokyo
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| S09E13 | 熱闘バトルチューブ！ VSチューブクイーン・アザミ!! |
January 5, 2006
TV Tokyo
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| S09E14 | 優勝は誰の手に！？ポケモンオリエンテーリング！ |
January 12, 2006
TV Tokyo
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| S09E15 | ゴンベのデビュー戦！ハーリーと真剣勝負!! |
January 19, 2006
TV Tokyo
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| S09E16 | ジュプトルVS（たい）トロピウス！草原の決闘!! |
January 26, 2006
TV Tokyo
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| S09E17 | ポケモンコンテスト！ユズリハ大会!! |
February 2, 2006
TV Tokyo
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| S09E18 | ジュカイン！ 復活の夜明け!! |
February 9, 2006
TV Tokyo
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| S09E19 | 激闘！バトルパレスでジャングルバトル！！ |
February 16, 2006
TV Tokyo
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| S09E20 | ウソハチキングとマネネクイーン!? |
February 23, 2006
TV Tokyo
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| S09E21 | 摩天楼の赤いイナズマ！ |
March 2, 2006
TV Tokyo
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| S09E22 | 大一番！ハルカＶＳタケシ!! |
March 9, 2006
TV Tokyo
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| S09E23 | ムチュールとルージュラ三姉妹!! |
March 9, 2006
TV Tokyo
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| S09E24 | タワータイクーン、リラ登場！ |
March 16, 2006
TV Tokyo
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| S09E25 | バトルタワー！以心伝心バトル!! |
March 23, 2006
TV Tokyo
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| S09E26 | ポケモンレンジャー！デオキシス・クライシス！！（前編） |
April 13, 2006
TV Tokyo
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| S09E27 | ポケモンレンジャー！デオキシス・クライシス！！（後編） |
April 13, 2006
TV Tokyo
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| S09E28 | ウソッキー！黄金伝説!? |
April 20, 2006
TV Tokyo
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| S09E29 | ハーリー＆ロケット団！悪役同盟結成!? |
April 27, 2006
TV Tokyo
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| S09E30 | ハルカＶＳムサシ！最後のコンテスト!! |
May 4, 2006
TV Tokyo
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| S09E31 | ロケット団解散!?それぞれの道！ |
May 11, 2006
TV Tokyo
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| S09E32 | タケシ＆サトシ！タッグバトルでニビジムを守れ！ |
May 18, 2006
TV Tokyo
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| S09E33 | バトルピラミッド！VSレジロック!! |
May 25, 2006
TV Tokyo
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| S09E34 | 驚異！巨大ケッキングの山！！ |
June 8, 2006
TV Tokyo
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| S09E35 | 開幕！ポケモンコンテスト・グランドフェスティバル！！ |
June 15, 2006
TV Tokyo
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| S09E36 | ハルカVSハーリー！ ダブルバトルでステージ・オン!! |
June 22, 2006
TV Tokyo
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| S09E37 | ハルカVSシュウ！ 最後の戦い!! |
June 29, 2006
TV Tokyo
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| S09E38 | エイパムと王様！ |
July 6, 2006
TV Tokyo
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| S09E39 | ペラップとポケモン漫才！ |
July 20, 2006
TV Tokyo
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| S09E40 | 襲撃！はぐれマニューラ!! |
July 27, 2006
TV Tokyo
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| S09E41 | バトルピラミッド再び！VSレジスチル!! |
August 3, 2006
TV Tokyo
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| S09E42 | ハルカＶＳシュウ！ライバルよ永遠に！！ |
August 10, 2006
TV Tokyo
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| S09E43 | ポケモンセンターはおおいそがし！ |
August 17, 2006
TV Tokyo
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| S09E44 | 最初のポケモン！ 最後の戦い!! |
August 24, 2006
TV Tokyo
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| S09E45 | 決戦！ＶＳレジアイス！！ |
August 31, 2006
TV Tokyo
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| S09E46 | サトシＶＳハルカ！ラストバトル!! |
September 7, 2006
TV Tokyo
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| S09E47 |
旅の終わり、そして旅の始まり！
season finale
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September 14, 2006
TV Tokyo
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