Paris, 1899. Le président Félix Faure vient de mourir dans les bras de sa maîtresse. Alors que la République est au bord de l'explosion, le préfet Lépine est rappelé aux affaires. Au même moment, à la préfecture, l'inspecteur Jouin est mobilisé sur une enquête d'envergure pour identifier "l'inconnue de la valise".
La courtisane Meg, devenue espionne pour le compte de Puybaraud, chef de la Sûreté et ennemi juré du Préfet, infiltre les Guérin. A la Sûreté parisienne, Jouin enquête avec le commissaire Cochefert sur l'affaire de la valise sanglante et la disparition de Joséphine Berger. Fiersi se fait affecter à l'enquête.
L'inspecteur Jouin s'est épris de Jeanne Chauvin, une jeune avocate au caractère bien trempé, qui ne peut exercer mais officie en tant qu'assistante auprès de maître Weidmann dans le quartier juif. Elle décide de l'aider dans l'affaire Berger. De son côté, Meg reçoit chez elle madame Lépine, la femme du préfet, dont le penchant pour les paradis artificiels n'a pas échappé au commissaire Puybaraud.
A la Sûreté, tout le monde s'active pour résoudre l'affaire Berger ; la police a besoin de prouver son efficacité. A quelques jours de l'ouverture du procès Dreyfus, la tension monte dans les rues de Paris. Lépine déjoue à son avantage le piège du scandale personnel tendu à sa femme.
Meg est tombée sous le charme de Gabriel Sabran, tandis que de plus en plus d'éléments apparaissent à charge contre lui dans l'enquête sur le meurtre de Joséphine. Ce rapprochement fait d'elle un témoin particulièrement gênant pour les Guérin et le père de Gabriel...
Épuisé par des années d'asservissement et écœuré par l'affaire Berger, Fiersi se désolidarise de Puybaraud. Il fournit à Jouin un élément essentiel dans son enquête, lequel compte toujours sur le soutien de Jeanne pour l'aider dans cette affaire. Jules Guérin, de son côté, s'est retranché rue Chabrol...
Tandis que Maman Guérin organise les derniers détails des émeutes qui doivent converger rue Chabrol, le préfet Lépine reçoit l'aide inattendue des anarchistes. Fiersi est en cavale, Jouin poursuit seul l'enquête et protège Jeanne du meurtre qu'elle vient de commettre pour le sauver lui...
Jouin veut découvrir toute la vérité sur les Sabran, prenant le risque de perdre Jeanne. Meg songe désormais à l'avenir et joue sa dernière carte auprès du préfet. Lépine, fin stratège, laisse le temps œuvrer en sa faveur dans l'affaire dite du Fort Chabrol. Son épouse lui offre un soutien inattendu...
24 décembre 1904. Alors que l’inspecteur Antoine Jouin tente d’identifier un cadavre retrouvé au bois de Boulogne, la police des mœurs rafle les prostituées des rues de Paris dont une jeune femme, Rosalie Dantremont, provoquant la mort de son enfant nouveau-né laissé seul dans son berceau.
Pour éviter le scandale causé par la mort du nouveau-né, le préfet Lépine couvre la brigade des mœurs et demande à Jouin de rester discret au sujet de l’affaire Dantremont. Pendant ce temps, Meg prépare le vernissage de son mari avec l’aide de Fiersi ; un vernissage auquel elle a convié son protecteur, le préfet Lépine.
Alors que Meg découvre qu’Adolphe a la syphilis, Jouin identifie le mort du bois et découvre qu’il était lié au meurtre non élucidé d’un notaire couvert par la police des moeurs. Le Préfet lui aussi songe à démissionner. Usé par le pouvoir, l’affaire Rosalie Dantremont a achevé de le convaincre qu’il n’avait plus sa place à la Préfecture.
Lépine prépare son départ de la Préfecture, Louise fait alliance avec Hector, le secrétaire particulier du Préfet, pour le faire renoncer à sa démission. L’enquête de Jouin sur le mort du bois et son hostilité suite à l’affaire Rosalie Dantremont obligent la police des moeurs à réagir : l’inspecteur Guichard vient arrêter Jouin en l’accusant d’être un "inverti".
Jouin demande de l’aide à Fiersi pour entrer par effraction dans le château de Bagatelle. Pendant ce temps, Cochefert remonte la piste du docteur Verlot et comprend qu’il travaille avec la brigade des moeurs dans cette vaste entreprise de chantage qui leur permet de tenir tout Paris en leur pouvoir.
Une fois dans le château de Bagatelle, Jouin et Fiersi attirent Guichard dans un piège. Alors que Lépine reprend le pouvoir au sein de la Préfecture, Meg peut enfin faire le vernissage de son mari et rouvrir son cercle de jeu avec l’inauguration d’une nouvelle distraction, la roulette.
