| Name | First Aired | Runtime | Image | |
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| S06E01 | 幻の都！雄大なるシャンドラの遺跡！！ |
November 16, 2003
Fuji TV
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| S06E02 | 生存率0%！！チョッパーVS神官オーム |
December 21, 2003
Fuji TV
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| S06E03 | "巨大豆蔓ジィアントジャック"を登れ！！上層遺跡の死闘 |
January 11, 2004
Fuji TV
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| S06E04 | 鉄の試練の真骨頂！白荊デスマッチ！！ |
January 18, 2004
Fuji TV
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| S06E05 | ほとばしる斬撃！ゾロVS神官オーム！！ |
January 25, 2004
Fuji TV
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| S06E06 | 崩れゆく上層遺跡！終曲フィナーレへの五重奏クインテット！！ |
February 1, 2004
Fuji TV
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| S06E07 | 古代遺跡の対決！神ゴッド・エネルの目的！！ |
February 8, 2004
Fuji TV
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| S06E08 | 限りない大地フェアリーヴァースへの野望方舟マクシム！！ |
February 15, 2004
Fuji TV
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| S06E09 | 遂に激突！海賊ルフィVS神ゴッド・エネル！！ |
February 22, 2004
Fuji TV
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| S06E10 | マクシム浮上！動き始めたデスピア！！ |
February 29, 2004
Fuji TV
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| S06E11 | ルフィ落下！神の裁きとナミの望み！！ |
March 7, 2004
Fuji TV
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| S06E12 | 目覚めた二人！燃える恋の救出前線！！ |
March 14, 2004
Fuji TV
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| S06E13 | 絶望への狂想曲カプリッチオ迫り来る空島の消滅！！ |
March 21, 2004
Fuji TV
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| S06E14 | 鐘の音の導き！大戦士と探検家の物語 |
March 28, 2004
Fuji TV
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| S06E15 | 呪縛からの解放！大戦士が流した涙！！ |
March 28, 2004
Fuji TV
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| S06E16 | 永遠の親友！大海原に響く誓いの鐘！！ |
April 4, 2004
Fuji TV
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| S06E17 | エンジェル島消滅！雷迎降臨の恐怖！！ |
April 25, 2004
Fuji TV
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| S06E18 | 巨大豆蔓ジャイアントジャックを倒せ！脱出への最後の望み |
May 2, 2004
Fuji TV
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| S06E19 | 神の国の奇跡！天使に届いた島の歌声 |
May 9, 2004
Fuji TV
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| S06E20 | 戦いの終焉！遠く響く誇り高き幻想曲ファンタジ |
May 23, 2004
Fuji TV
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| S06E21 | 我ここに至る！歴史の本文ポーネグリフが紡ぐもの |
June 6, 2004
Fuji TV
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| S06E22 |
いざ青海へ！！想いが織りなす最終楽章
season finale
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June 13, 2004
Fuji TV
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| S06E23 | 非常事態発令！悪名高き海賊船潜入！ |
June 20, 2004
Fuji TV
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| S06E24 | 料理人サンジ！海軍食堂で真価発揮！ |
July 4, 2004
Fuji TV
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| S06E25 | 囚われたゾロとチョッパー緊急執刀！ |
July 11, 2004
Fuji TV
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| S06E26 | 迫る海軍の捜査網！囚われた二人目！ |
July 18, 2004
Fuji TV
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| S06E27 | 決死のルフィとサンジ！救出大作戦！ |
August 8, 2004
Fuji TV
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| S06E28 | 熱血特別部隊参戦！ブリッジ攻防戦！ |
September 5, 2004
Fuji TV
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| S06E29 | 包囲網突破！奪還ゴーイングメリー号 |
September 12, 2004
Fuji TV
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| S06E30 | 消えた海賊船！要塞攻防第2ラウンド |
September 19, 2004
Fuji TV
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| S06E31 | 黄金奪還作戦とウエイバー回収作戦！ |
October 3, 2004
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| S06E32 | 一網打尽計画！ジョナサン自信の秘策 |
October 3, 2004
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| S06E33 | さらば海軍要塞！脱出への最後の攻防 |
October 10, 2004
Fuji TV
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