Zwei Männer pakistanischer Herkunft werden entführt. Ein dritter Pakistani, der an der Universität ein Kollege von Charlie ist, wird verhaftet, weil er angeblich geheime Dokumente an eine pakistanische Terrorgruppe gemailt hat. Charlie und Don arbeiten zusammen an dem Fall und bald stellt sich heraus, dass sie vollkommen anderer Auffassung sind.
In the season finale, Don and Charlie work together on a case that ends up with them going head to head about their personal beliefs, and one team member will walk away forever.
Don et Charlie planchent sur un cas délicat de terrorisme où ils confrontent ardemment leurs opinions. Deux enlèvements par un groupe armé ont conduit le FBI jusqu’à une organisation humanitaire pakistanaise. Puis, un scientifique et ami de Charlie est arrêté ; ce qui met ce dernier en porte-à-faux avec le FBI et lui pose un cas de conscience professionnelle lorsque ses théories prouvent l’innocence de ce suspect. Dans cette ambiance particulièrement tendue, un membre de l’équipe de Don envisage de quitter le FBI…
Don e Charlie sono coinvolti in un caso di sicurezza nazionale; durante le indagini un collega di Charlie viene arrestato in quanto sospettato di far parte di un gruppo di terroristi. Diverse ideologie creano una frattura tra i due fratelli e un membro del gruppo si allontana definitivamente dal team.
El equipo de Eppes investiga el secuestro de varios hombres. Los sujetos tenían en común su pertenecía al Fondo Internacional de Pakistán (FIP), una organización no gubernamental que financia diferentes proyectos en Pakistán y Bangladesh. Los policías piensan que se trata de una célula de la Yihad. Charlie está muy afectado con el caso, ya que uno de los presuntos miembros es investigador y amigo suyo. Por otro lado, la agente Megan lleva un tiempo dudando si seguir con su brillante carrera en el FBI o dar a su vida un giro y terminar su doctorado.