忍術学園には謎がある。山本先生の愛馬はどこで飼っているのか？きり丸が売りに来るしぼりたてのミルクはどこから持ってくるのか？しんべヱの牛はどこへ消えてしまったのか？そこでくノ一たちは調査に乗り出し、きり丸の後をつけることにした。
