On the run from the Soukaiya, Yamoto stumbles into a church and collapses from exhaustion, only to be awakened by a ninja wearing a priest's cassock. Dr. Lee is desperate to recover a zombie ninja that has escaped his lab.
ソウカイヤから追っ手を差し向けられ逃亡の日々を送るヤモト・コキは、
流れ着いた教会の中で「ジェノサイド」と名乗る恐ろしいニンジャに出会う。
聞くと、彼はここに来るまでの記憶がほとんどないという。
実は彼は、ラオモトの下で働くマッドサイエンティスト「リー先生」に作られたゾンビーニンジャであり、
自我に目覚め、リー先生のラボから逃亡したのだった。
教会で束の間の休息を取るヤモトとジェノサイドのもとへ、
リー先生の助手フブキ・ナハタが作った最新バイオニンジャ「マンティコア」が、
さらにヤモトを追うソウカイヤの刺客「グレネディア」、ふたりの刺客が送りこまれた！
ナムアミダブツ！ 共闘を決めたヤモトとジェノサイドの運命やいかに！？
Ямото Коки, которого преследует Сокаия, ведет дни в бегах. В заброшенной церкви он встречает ужасного ниндзя по имени Геносайд. Как выясняется, у него почти нет воспоминаний о том, как он сюда попал. На самом деле он зомби-ниндзя, созданный безумным ученым Ли, работающим на Лаомото, и он пробудил свое сознание, сбежав из лаборатории Ли. Пока Ямото и Геносайд отдыхают в церкви, к ним на помощь приходит новейший био-ниндзя Мантекора, созданный помощником Ли Фубуки Нахата, а также на Ямото нападают ассасины Сокаия, Гренадир. Какова же судьба Ямото и Геносайда, решивших объединиться в борьбе? Наму Амидабуцу!
