After a massive drug deal is interrupted, Arson, one of the Soukaiya's ninjas, faces Ninja Slayer in a battle to the death. Ninja Slayer has his hands full while taking on a techno-ninja named Cloud Buster.
妻子の復讐のため、ソウカイヤのニンジャを殺し続けるニンジャスレイヤー。
次なる敵は「カトン・ジツ」を操るニンジャ、アーソン。
さらに上空からはオムラ社の差し向けた武装マグロ・ツェッペリンが迫り、
レーザーと追尾ミサイルの波状攻撃が彼を襲う。
ピンチに陥るニンジャスレイヤー、果たして勝負のゆくえは……！？
