Da sie keine andere Wahl hat, macht sich Shigure zusammen mit Dakuan und Tsubute auf die Suche nach ihrer Vergangenheit. Zur gleichen Zeit wird Jûbei von Ninja-Dämonen verfolgt, die ihm das Drachenjuwel stehlen wollen…doch es ist Jûbeis Aufgabe, Shigure den Steich zu überbringen.
With no other choice, Shigure sets out with Dakuan and Tsubute to find the answers about who she really is. Meanwhile, Jubei must fight off both Hiruko and Kimon ninjas and deliver the Dragon Stone to Shigure.
A travers leur parcours, Jubei et Shigure sont séparés. Cette dernière décide de poursuivre son chemin à la recherche de son passé aux côtés de Dakuan et d’un jeune ninja plein de vie nommé Tsubute. Jubei est poursuivi par les démons ninjas qui cherchent à lui voler la Pierre du Dragon…
Jubei deve trovare un modo per dare la Pietra del Drago a Shigure pur essendo braccato sia dalla Clan Hiruko e Kimon Shu. Dopo che il suo villaggio viene distrutto, Shigure vaga impotente fino a quando non incontra Tsubute Dakuan e che sono disposti ad aiutarla a scoprire chi è veramente.
Mientras Jubei busca a la princesa, el clan Kimon ataca a ésta y el clan Hiruko a Jubei para recuperar la piedra.