クスコの街が円盤に襲撃される。それを操っていた古代インカ帝国の女王エスコは、時間移動システムの研究者フローレ博士とうり二つだった。その謎を解明するため円盤を追った鉄人と正太郎は、円盤と共に消滅。気がついたときには、450年前の古代インカ帝国の地に降り立っていた！
