くるみ割り人形 / ピョートル・チャイコフスキー
『四季』春 / ヴィヴァルディ
恋はあせらず / スプリームス
Chaiyya Chaiyya / A・R・ラフマーン
神田川 / かぐや姫
ラプソディ・イン・ブルー / ガーシュウィン
カノン / パッヘルベル
ラ・ヴィ・アン・ローズ / エディット・ピアフ
ブラジルの水彩画 / アリー・バロッソ
故郷へかえりたい / ジョン・デンバー
ゴジラメインタイトル / 伊福部昭
カイマナヒラ
長い道を
東京ブギウギ / 笠置シヅ子
Djobi Djoba / ジプシー・キングス
魔王 / フランツ・シューベルト
スタンド・バイ・ミー / ベン・E・キング
北風小僧の寒太郎 / 堺正章
聖者が町にやって来る
木星 / グスターヴ・ホルスト
トルコ行進曲 / モーツァルト
帰ってほしいの / ジャクソン5
チャタヌーガ・チュー・チュー
津軽じょんから節
リベルタンゴ / アストル・ピアソラ
ウィズイン・ユー・ウィズアウト・ユー / ビートルズ
勇敢なるスコットランド
剣の舞 / アラム・ハチャトゥリアン
フライ・ミー・トゥ・ザ・ムーン
メロトロン号でパーティー
ライク・ア・ローリング・ストーン / ボブ・ディラン
マシュ・ケ・ナダ / セルジオ・メンデス
サウンド・オブ・サイレンス / サイモンとガーファンクル
ボーン・トゥ・ラヴ・ユー / クイーン
Can't Give You Anything (But My Love) / スタイリスティックス
Lag Jaa Gale（英語版） / ラタ・マンゲシュカル
ツァラトゥストラはこう語った / リヒャルト・シュトラウス
私のお気に入り / リチャード・ロジャーズ
待ちぼうけ / 山田耕筰 〜 FIRECRACKER / Martin Denny
主よ、人の望みと喜びよ / J.S.バッハ
ダッタン人の踊り / アレクサンドル・ボロディン
賽馬 / 黄海杯
ウィ・ウィル・ロック・ユー / クイーン 〜 村祭り
きらきら星変奏曲 / モーツァルト
子象の行進 / ヘンリー・マンシーニ
ユー・アー・マイ・サンシャイン
マンボNo.5 / ペレス・プラード
黒ネコのタンゴ / 皆川おさむ
Monkey Magic / ゴダイゴ
ストロベリー・フィールズ・フォーエバー / ビートルズ
EIGHT MELODIES / 鈴木慶一 田中宏和
学園天国 / フィンガー5
天国と地獄 / オッフェンバック
ゴッドファーザー・愛のテーマ / ニーノ・ロータ
あんたがたどこさ
ラブ・ストーリーは突然に / 小田和正
イエヴァン・ポルッカ / エイノ・ケットゥネン
シング・シング・シング / ルイ・プリマ
『アルルの女』より「ファランドール」 / ジョルジュ・ビゼー
スリラー / マイケル・ジャクソン
ミザルー / ディック・デイル
2台のピアノのためのソナタ K.448 / モーツァルト
藁の中の七面鳥
ワン・モア・タイム / ダフト・パンク
水の戯れ / モーリス・ラヴェル
テイク・ファイブ / デイヴ・ブルーベック・カルテット
ドント・ストップ・ミー・ナウ / クイーン
虹の彼方に / オズの魔法使い
アリーナの旅立ち１～わたしとピッコリーノ号～ 出演：斎藤アリーナ、浜野謙太、サンコンＪｒ．なつかしいドットーレと再会！
アリーナの旅立ち２～私とメロトロン号～斉藤アリーナ、オダギリジョー、鈴木慶一、ＡＳＡ－ＣＨＡＮＧほか。メロトロン号メンバーとドクトルジョーと再会！
アリーナの旅立ち３～ふたりの約束～斉藤アリーナ、ケンタロウ、西條妃華、ハッチハッチェルほか。アリーナはルチオを伴ってハッチェル船へ！
アリーナの旅立ち４～修了式～斉藤アリーナ、ＲＯＬＬＹ、ドクトルジョー、浜野謙太、鈴木慶一ほか。シーズン１から５の仲間たちが全員集合！
ばらの花 / くるり
アヴェ・マリア / シャルル・グノー
My Generation / ザ・フー
アイ・ガット・リズム / G.ガーシュウィン
セプテンバー / アース・ウィンド・アンド・ファイアー
プレイバックpart2 / 山口百恵
北九州炭坑節
ワンダーウォール / オアシス
モリエンド・カフェ / ウーゴ・ブランコ
『レクイエム』から「怒りの日」 / ジュゼッペ・ヴェルディ
クリック・ソング / ミリアム・マケバ
ブルー・マンデー / ニュー・オーダー
ダンシング・クイーン / ABBA
FUNKASTIC / RIP SLYME
歌劇『カルメン』よりハバネラ「恋は野の鳥」 / ジョルジュ・ビゼー
ドント・ウォリー・ビー・ハッピー（英語版） / ボビー・マクファーリン
三百六十五歩のマーチ / 水前寺清子
２０分拡大特集番組「外伝」を放送！ベルカント号に、時計台に潜むモンストロの調査という特別任務があたえられた！
風をあつめて / はっぴいえんど
ケ・セラ・セラ / ドリス・デイ
Hotel California / イーグルス
アラベスク第1番 / クロード・ドビュッシー
Tunak Tunak Tun / ダレル・メヘンディ
津軽海峡・冬景色 / 石川さゆり
やさしさに包まれたなら / 荒井由実
銀河鉄道999 / ゴダイゴ
Baby Let's Play House / エルヴィス・プレスリー
Agua De Beber / アントニオ・カルロス・ジョビン
ボラーレ / Gipsy Kings
イミグラント・ソング / レッド・ツェッペリン
ジムノペディ 第1番 / エリック・サティ
待つわ / あみん
TECHNOPOLIS / イエロー・マジック・オーケストラ
ハイサイおじさん / 喜納昌吉&チャンプルーズ
歌劇『魔笛』から「復しゅうの心は地獄のように胸に燃え」 / モーツァルト
イエスタデイ・ワンス・モア / カーペンターズ
星めぐりの歌 / 宮沢賢治
ムジカ・ピッコリーノ２０分拡大特集番組「外伝」を放送！今回は、ベルカント号が偶然通りかかった森を舞台にストーリーが展開。ラストはあの名曲のムジカ版を披露！
ムジカドクターのシエリの旧知の仲であり、かつて一緒にモンストロ治療を行ったことのある友人が助っ人として登場。
キャラバンの到着 / ミシェル・ルグラン
君の瞳に恋してる / フランキー・ヴァリ
劇付随音楽『ペール・ギュント』から「山の魔王の宮殿で」 / エドヴァルド・グリーグ
I Get Around / ビーチ・ボーイズ
Tico-Tico no Fubá（英語版） / カルメン・ミランダ
NIGHT OF FIRE / NIKO
蘇州夜曲 / 李紅蘭
キャント・ストップ（英語版） / レッド・ホット・チリ・ペッパーズ
会津磐梯山
Around the World / ダフト・パンク
カリンカ / イワン・ラリオーノフ
Choo Choo TRAIN / ZOO
幻想即興曲 / フレデリック・ショパン
MY WAY / フランク・シナトラ
I Will Always Love You / ホイットニー・ヒューストン
ばらの花 / くるり
ダイナマイト / SMAP I Get Around / ビーチ・ボーイズ 歌劇『カルメン』よりハバネラ「恋は野の鳥」 / ジョルジュ・ビゼー NIGHT OF FIRE / NIKO[注釈 18]
シーズン９がはじまります！「ムジカ・ピッコリーノ」モンストロを治療して音楽の記憶をよみがえらせるムジカドクターたちの物語。
「ムジカ・ピッコリーノ」▽第２話。森で出会った少年トットの住まいを訪れるのだが、そこに待っていたのは傷ついたモンストロだった。
ムジカドクターのシエリは、いまだ森を抜け出せない。アルカ号のエンジンを再起すべく森に出かけたシエリとトットの前にあらわれたのは、またも傷ついたモンストロだった。
モンストロを治療することでアルカ号の歯車は再び動き始めた。船を飛ばしムジカアカデミーへの帰還をめざすシエリの前に、またも不思議な船の住人が現れる。
アルカ号の仲間たちの華々しい活躍と迫力の仕上げの演奏。モンストロの生態についてモレッティ連絡官がこっそり教えます。
ムジカ・アカデミーからアルカ号を動かすために機関士がやってくるという。新たな出会いに浮き立つトットの耳に壊れたモンストロの声が聞こえてくるのだった。
アルカ号はとても古い船。機関士のルネッタいわく飛び立たせるには設計図のようなものが必要だという。探すシエリたち。設計図は見つかるのだろうか。
ついに大空に飛び立ったアルカ号。興奮するトットはあることに気づく。ムジカアカデミーに着いたら、一緒にモンストロ治療の冒険をしたシエリさんとお別れなのだ。
トットのひそかな憧れを見抜いたアルカ号船長のフォリアは彼をムジカアカデミーに入学させたいとシエリに頼み込む。シエリは改めてトットの素質について考え始める。
ムジカドクターのシエリからＲＯＬＬＹ司令官への電話をこっそり聞いたモレッティ連絡官が、アルカ号の活躍をこっそり教えます。
トットをムジカドクター育てるまでアカデミーに戻らないと決めたシエリ。さっそく特訓が始まる。一方でアカデミーでは、シエリが戻らないことを不審に思っていた。
トットはシエリからムジカアカデミーに入るための訓練を受け、ルッチョラは船の操縦をルネッタに教わっている。トットとルッチョラは不満や焦りがあるようだ。
モンストロを治療したらドクターは報告書を書くのが決まりだ。トットもシエリの報告書作成を手伝いながらちょっとお腹がすくような話題で盛り上がっていた。
トットが大切にしている「診察機」をシエリが壊してしまった。診察機は修理できるのか？気まずい二人の溝は埋まるのか？だが機械の故障がモンストロの治療のヒントを生む。
モンストロ治療の報告書を手に入れたムジカアカデミーから、モレッティ連絡官がアルカ号の活躍をこっそり教えます。
アルカ号の居場所がムジカ・アカデミーにバレてしまった！逃げるアルカ号に、シエリを連れ戻そうと追うアカデミーの影が、ゆっくりと迫ってくる。
シエリとルネッタのいなくなってしまったアルカ号。さみしさを感じつつ、また行き先も定まらないドクター不在の船。そんな時に壊れてしまったモンストロを発見する。
シエリから贈られたノートには待ち合わせのメモが潜んでいた！アルカ号の仲間たちが力を合わせ、シエリの奪還作戦を展開する！
アルカ号の仲間たちの華々しい活躍と迫力の仕上げの演奏。モンストロの生態についてモレッティ連絡官がこっそり教えます。
巨大モンストロにより危機に陥ったムジカアカデミー。シエリは「機械を直すのがアルカ号の仕事」と戻る決意をする。アルカ号の仲間たちはを危機を救うことができるのか？
新シーズンスタート！ムジカドクターの候補生となり、モンストロ治療への意欲に燃えるトット。この日も不思議に満ちた「モンストロの謎」がトットの前に立ちふさがる。
快調にモンストロ治療の旅を続けるアルカ号。ムジカアカデミーのローリー司令官からの提案は意外なものだった。
アルカ号の船内を捜索しているメンバーたち。トットは船内で古くて開かない金庫を発見した。さっそく開けてみるトットとシエリ。中にはいっていたものは。
古くて大きいアルカ号の船内には、船長のフォリアでさえ、まだ把握していない小さな部屋や開けたことのない扉が隠されていた。
アルカ号とムジカドクターたちの活躍はアカデミーＲＯＬＬＹ司令官に報告される。司令官の近くでモレッティ連絡官がこっそり聞き出した内容をまとめてお知らせする。
アルカ号の船内奥深くに眠っていた怪しい小部屋。その中には見たことのない装置やガラクタが積み重なっていた。そしてどこからかモンストロの鳴き声が聞こえてくる。
小部屋から見つかった手帳はとても古いものだった。アルカ号の秘密を探るトットたちはその手帳を読み進めていくのだがそこには驚くべきことが書かれていた。
手帳に残されていたのはトットやフォリアと同じエンジニアの手記だったようだ。過去の知恵に出会い興奮するトットの前に現れたのは、大きな口を持ったモンストロだった。
ついにたどりついた工房都市。かつてモンストロが生み出されていた荒野の町。アルカ号のメンバーはマズローの秘密を探るべくマズローのかつての工房へ向かった。
ＲＯＬＬＹ司令官は焦った様子で電話をかけている。相手はモレッティも驚くような人物だ。司令官が電話をしている隙に、モレッティがアルカ号の活躍を皆さんにお伝えする。
モンストロ開発者の秘密はアルカ号だけでなく全てのムジカドクターの存在を揺るがすことだった。アルカ号のメンバーは気持ちを合わせてモンストロ治療にいどむ。
ムジカドクターのシエリの旧知の仲であり、かつて一緒にモンストロ治療を行ったことのある友人が助っ人として登場。
工房都市へ向かうのは容易ではない。そこでフォリアはアルカ号の奥深く眠っていたあるものを使うことを提案する。トットにとって新たな楽器との出会いとなるのだった。
ついにたどりついた工房都市。かつてモンストロが生み出されていた荒野の町。アルカ号のメンバーはマズローの秘密を探るべくマズローのかつての工房へ向かった。
モンストロ開発時の秘密が明らかになるにつれ、ムジカムンド国王のねらいが見えてきた。ムジカドクターたちの未来はどうなるのか。これまでの出来事をおさらいする。
ムジカアカデミーからの通達はアルカ号メンバーにとって衝撃の内容だった。夜空に一人たたずむトットの繊細な心に引き寄せられるように、モンストロが現れるのであった。
かつてトットたちが住んでいたフンギの森には、彼らだけが知っている秘密基地があった。森で拾ったもので作ったガラクタだらけの秘密基地に、じつはあるものが隠れていた。
手帳の記述に導かれ、ある場所におもむくアルカ号メンバー。そこにいたモンストロの治療は、一見順調に進んだかと思ったが、これまでにない、あることが起こってしまう。
前代未聞の事態に驚き、また自身のふがいなさに悔しがるＲＯＬＬＹ司令官。そこに連絡が来たシエリからの通信によって真実が伝えられる。
ムジカムンド国王に、モンストロ開発者マズローの思いを伝えようとアルカ号メンバーは意気込む。ちょうどその時現れたのは司令官の見覚えのあるモンストロだった。
ムジカ・ピッコリーノは１０年目の２０２２年度前期の放送をもって新作シリーズ終了となった。かつての出演者を迎え、ムジカドクターの活躍と名場面を振り返る特別番組。