The Minerva engages Neo and the 3 stolen Gundams in a battle over the Indian Ocean.
Le Phantom Pain prend en embuscade le Minerva et le Nyiragongo. L’équipage de ZAFT ne se laissera pas faire, notamment Shinn, surtout quand il verra qu’une base ennemie est en construction non loin du champ de bataille.
カーペンタリアを出発したミネルバは、潜水艦・デグチャレフと共にジブラルタルへ向かった。その頃ネオは、そこから程近い半島で密かに地球軍基地建設の任に就いていた部隊から、ウィンダム大部隊を借り受けていた。援軍を得たネオは、スティングと共にミネルバを襲撃する。迎え撃つ、アスランとシン。だが、それはネオの巧みな陽動作戦だった。水中深く潜行していたアビスガンダムが、ミネルバの目前に迫る。
その頃シンは、突如海岸線から現れたガイアガンダムを追って戦線から離れ、基地建設予定地に辿り着いてしまう。そこでは、基地建設のために借り出された現地の民間人たちが、強制労働させられていた。その光景を見たシンは、逆上する。
慣れない水中戦に戸惑うレイとルナマリアのザクを尻目に、アウルはデグチャレフを一撃のもとに轟沈させてのけた。怒りに燃えるシンは、基地施設や戦闘車両を次々と破壊する……民間人たちを解放するためとはいえ、それはある意味一方的な虐殺であった。
アスランはシンを平手打ちし、「自分だけで勝手な判断を下すな！ 力を持つ者なら、その力自覚しろ！」と怒鳴りつける。シンの瞳には、反抗的な光が宿っていた。
尼奥调集了附近地球联合军据点的MS，并亲自驾驶温达姆带队对密涅瓦号一行展开了攻击。密涅瓦号被迫迎战，阿斯兰决定与真一同出击，并被塔丽亚委以MS部队指挥的重任；而雷和露娜玛丽亚则在舰上待机。驾驶混沌高达的斯汀·奥克雷选择了阿斯兰驾驶的救世主高达作为对手；尼奥则带队围攻在奥布突围一战中大出风头的真。
Минерва, покинув Карпентария, вместе с подводной лодкой Дегтярев направляется к Гибралтару. Тем временем Нео, получив от отряда, занимавшегося строительством базы на близлежащем полуострове, крупные силы Уиндам, вместе со Стингом нападает на Минерву. Встречают их Атрун и Шин, но это оказывается ловкой отвлекающей операцией Нео: глубоко погружённый Абисс-Гандам выныривает прямо у носа Минервы. Шин, преследуя внезапно появившийся с берега Гайя-Гандам, отрывается от линии фронта и выходит к месту планируемой стройки базы, где местных жителей принуждают к работе. Увидев это, он приходит в ярость. Пока Рей и Лунамария, не привыкшие к подводным боям, растерянно действуют, Аул одним ударом топит подлодку Дегтярев. Разъярённый Шин уничтожает по очереди базы и боевые машины — хотя цель его была освободить гражданских, по сути это превращается в одностороннюю резню. Атрун даёт Шину пощёчину и кричит: Не принимай решений в одиночку! Если у тебя…
