The world is thrown into chaos after the Break the World incident during the Second Bloody Valentine War. A ZGMF-1017 GINN attacks a city where DSSD members Selene McGriff and Edmond Du Clos are in and causes massive damage until it is stopped by a linear tank commanded by Edmond, who is mortally wounded in his attack. Meanwhile Selene and another DSSD member, Sol Ryuune L’ange, leave for space while Phantom Pain deploys its pilots to fight ZAFT mobile suits that attack an Earth Alliance base.
ザフトのテロリストによるユニウスセブン落下事件「ブレイク・オブ・ザ・ワールド」により、地球上に降り注いだプラントの破片群。それは世界のあらゆる都市を壊滅させ、未曾有の悲劇を生むこととなった。
同時期、DSSD（深宇宙探査開発機構）の開発センターの保安副部長である、エドモンド・デュクロと同技術員セレーネ・マクグリフもまた、被害を受け水没した市街地にて開発センターへの帰還の手段を探していた。
そこへ突然巻き起こる爆発。被災地の避難民と救援部隊は騒然となる。黒煙の先に姿を現したのは、一機の所属不明モビルスーツであった。最終実験段階となった宇宙探査用ＭＳ「GSX-401FWスターゲイザー」の開発計画を推し進めるため、セレーネを見送ったエドモンド。やがて彼は、暴走し砲弾を放つ所属不明機を見据え、不敵な笑みを浮かべていた。
一方、ファントムペインの基地にて惨状を見つめるスウェン・カル・バヤンたちの姿があった。下される出撃待機命令。起動を開始する漆黒の機体。
混迷を極める地上から、星はまだ見えない―。
Из-за теракта террористов Зафта, приведшего к падению Юниус Севен, на Землю обрушились обломки колоний. Это привело к разрушению городов по всему миру и невиданной трагедии.
В это же время Эдмонд Дюкро, заместитель начальника охраны исследовательского центра DSSD (Глубококосмическое Исследование и Разработка), вместе с техническим специалистом Селиной МакГрифф искали способ вернуться в центр, оказавшись в затопленном районе.
Внезапно раздается взрыв. Беженцы и спасательные команды в панике. Из черного дыма появляется неизвестный мобильный костюм. Эдмонд, провожая Селину, продолжает работу над проектом космического исследовательского МС «GSX-401FW Старгейзер», и вскоре он с ухмылкой наблюдает за неуправляемой машиной, которая начинает стрелять.
Тем временем, в базе Фантом Пейн, Свен Кар Баян и его команда наблюдают за ужасами. Получено приказание о готовности к вылету. Черный мобильный костюм начинает активацию.
С Земли, погруженной…
