Mazinkaiser, il prezioso dono lasciato dal professor Juzo Kabuto, è un aiuto determinante per l'Istituto di Ricerca nella sua battaglia contro il dottor Hell. Tuttavia pilotare il gigante meccanico non è una cosa semplice, tanto che, di fronte ad un nuovo attacco dei mostri meccanici, il dottor Yumi si trova costretto a mandare in azione solo Afrodite e il Grande Mazinga, quest'ultimo non ancora completamente riparato dopo gli ingenti danni della precedente battaglia...
알 수 없는 힘의 인도로 마징카이저와 할아버지의 비밀기지를 우연히 찾아낸 코우지. 그러나 그는 아직 마신황제를 자유로이 조종하기엔 무리가 있었다. 유미 교수는 마신황제의 강력함과 숨겨진 힘의 무서움 등을 코우지에게 경고해준다. 이때 또다시 습격하는 아수라의 비행요새 그루와 기계수군단. 코우지를 남겨두고 남은 일행은 출격한다. 하지만 아프로다이와 보스보롯트는 금방 적의 표적이 되어버리고 사야카를 보호하던 테츠야의 그레이트도 파워 회복이 충분치 못했기 때문에 아수라의 집중공세에 고전을 면치 못한다. 보다 못한 코우지는 굳은 결심을 한뒤 모두의 만류에도 불구. 카이저 파일더에 뛰어오른다.
あしゅら・マジンガーと機械獣軍団をこともなく倒したマジンカイザー！ だが、さやかたちの呼びかけも空しくマジンカイザーの光子力研究所への攻撃は止まらない。鉄也とグレートマジンガーはこれを阻止しようとするが、まったく歯がたたない。Z、グレートをも凌ぐ新たなるマジンガーの出現にドクターヘルは!?
