Después de que Boss le haga la vida imposible a los tres profesores, se logra el consenso: van a actualizar a Boss Borot para que pueda volar
光子力研究所の電源を断つため、機械獣ナイターンO3が原子力発電所を襲った。出動したマジンガーZに思わぬトラブルが持ち上がる。空を飛べないことを甲児にバカにされたボスが、自分のロボットにも飛行能力を与えようとスクランダーの誘導装置を盗み出してしまったのだ。ブロッケン伯爵はこの機に乗じてナイターンO3を改造。地面に釘付けになったマジンガーは、空中を素早く移動する機械獣に少しずつ追いつめられてゆく。