Auf dem Cluster, dem Machtzentrum "Seines Schattens", kommt es zu einem Aufstand der Priester. Sie lehnen sich dagegen auf, daß das zurückgebliebene Gehirn "Seines Schattens" systematisch die Zerstörung jeglichen Lebens betreibt, um eine uralte Prophezeiung von der Herrschaft des Gigaschattens wahrzumachen. Dem Anführer der Aufständischen, Yottskri, gelingt es unter Einsatz seines eigenen Lebens, das Hirn "Seines Schattens" zu spalten und eine Hälfte zu zerstören. Auch auf der LEXX gibt es Probleme. Kai bleibt nur noch wenig Zeit: Das Proto-Blut, das ihn in seinem lebensähnlichen Zustand erhält, geht zur Neige. Also müssen Kai, Zev, Stan und 790 in die Höhle des Löwen zurückkehren.
Kai is running out of protoblood, and a desperate Zev forces Stan to set course back to the Cluster through the fractal core. When they arrive they find they entire planet barren - everybody killed in "the cleansing", in preparation of the birth of the Gigashadow.
הצוות חוזר אל האשכול כדי להשיג עוד פרוטו-דם בשביל קאי, שעומד למות סופית, אבל שם מתברר שמתפתחת ישות חדשה ומבעיתה שמאיימת להכחיד את האנושות כולה.
Протокровь, вещество, поддерживающее жизнедеятельность Кая в течение 2000 лет, на исходе. Команда Лексса решается вернуться на Кластер — единственное место изготовления протокрови. Вернувшись обратно во Вселенную Света, они обнаруживают, что на Кластере нет ни одного человека. Они понимают, в чём дело: здесь прошла Чистка — кормление голодных глубин Кластера всеми живущими в Лиге 20 000 планет, последняя фаза Возрождения Тени Гига — насекомого, величина которого превышает все мыслимые размеры живых существ которое призвано возродить расу Насекомых и покончить с человечеством. Наши герои, сами того не желая, вступают в схватку с неуязвимым противником.