Nach einer eingehenden Suche, die fast Nikitas Leben gekostet hat, trifft sie schließlich auf ihren Vater - den richtigen "Mr. Jones" und tatsächliches Oberhaupt des Center !
Sehr zu Nikitas Verärgerung weigert sich Mr. Jones ihre Fragen über ihre Rektutierung zu beantworten und schickt sie stattdessen auf eine Mission, um eine Computerdiskette zu beschaffen, die für die Kollektive bestimmt war. Sie enthält Informationen, die Jones' Verdacht, daß sich ein Maulwurf der Kollektive in der Sektion befindet, bestätigt.
Die Beweise deuten entweder auf Operations oder O'Brien und Jones befiehlt Nikita, daß sie herausfinden soll um welchen von beiden es sich handelt. Nikitas Untersuchung ergibt, daß weder O'Brien, noch Operations schuldig sind. O'Brien wird später durch eigene Schuld bei einer Mission getötet.
Nikita stellt fest, das der Maulwurf ein Agent sein muß, der nicht länger für die Sektion arbeitet, so wie Michael ...
Nikita finally comes face to face with her father, the real Mr. Jones, but rather than being an "emotional" reunion, Mr. Jones is all business, and immediately sets Nikita out on a new mission; finding The Collective's "mole" in Section One! Mr. Jones' two candidates: Operations or Marco O'Brien. Mr. Jones thinks it's the latter, but Nikita suspects the former. So Nikita sets out to find the "mole." Meanwhile, the two co-heads of The Collective, Graff and Haled clash over tactics, and whether to trust their "mole's" intel about Section One. Michael finally turns up, but not until the last scene!
Nikita rencontre enfin en face à face son père, le vrai M. Jones, mais plutôt que des retrouvailles "émotionnelles", il ne pense qu'aux affaires et envoie immédiatement Nikita sur une nouvelle mission : retrouver la "taupe" du Collectif dans la Section Une. Les deux suspects de M. Jones sont Operations et Marco O'Brien.
Nikita finalmente si ritrova faccia a faccia con il suo vero padre, Mr. Jones che le svela di essersi rivelato perché nella Sezione c’è una talpa che passa le informazioni al Collettivo. L’obiettivo è categorico, bisogna scoprire di chi si tratta e i sospetti ricadono su Operations, O’Brian, Quinn e Walter … ma alla fine della puntata la vera talpa viene svelata, si tratta di Michael.
Никита, наконец-таки, узнает что Мистер Джонс и есть ее отец. Они на пару начинают выяснять кто в Отделе предатель, потому что у Отдела одна за другой миссии проваливаются, т.к. противник ("Коллектив") заранее узнает их планы. В результате этого под арестом оказывается Шеф и под подозрением О'Брайан. НО! На самом деле информацию давал "Коллективу" целый и невредимый Майкл! Он решил (вроде как) сотрудничать с "Коллективом", чтобы уничтожить Отдел и таким образом освободить Никиту и себя, собственно говоря. В Центре пока не догадываются, что это Майкл портит им всю малину и поэтому упорно думают кто бы это мог быть?
Nikita se encuentra cara a cara con su padre y finalmente descubre la razón por la que fue llevada a Section One.