Nikitas Beteiligung bei der Bewertung der Sektion, die das Center durchführen ließ, hat schockierende Veränderungen zur Folge - Madelines Selbstmord, Walters Versetzung, Michaels Beseitigung und Operations Degradierung.
Nun besteht Nikita darauf, daß der Kopf des Centers, Mr. Jones seinen Teil der Abmachung erfüllt, indem er ihr erlaubt Veränderungen vorzunehmen, die die Sektion humaner machen sollen. Aber dann entdeckt die Sektion die Formatierung einer neuen terroristischen Untergruppe, die "Die Kollektive" genannt wird. Mr. Jones zwingt Nikita zurück ins Feld. Sie bekommt einen neuen Partner, Marco O'Brien. O'Brien war der Cop, der gewaltsam vor vier Jahren von der Sektion rekrutiert wurde, da er hinter Nikita herschnüffelte ! Und zusammen mit Operations, Kate Quinn (die inzwischen Operations Freundin ist !) und zahlreichen andern, ist er anfangs nicht gerade gut auf Nikita zu sprechen. Wird es ihr möglich sein nicht nur den Verlust von Michael, sondern auch die Bedrohung, die von ihrem Umfeld ausgeht zu überleben?
Nikita und O'Brien bekommen den Auftrag, sich bei einem Treffen der Kollektive als Sicherheitskräfte einzuschleichen und für den richtigen Zeitpunkt des Abschusses einer Rakete auf das Haus bescheid zu geben, wenn alle anwesend sind...
Um wenigstens einen Vertrauten in der Sektion zu haben, holt Nikita schließlich Walter wieder zurück.
Nikita is sent back to Section One to destroy a new terrorist threat that only she can deal with which is a summit meeting of representatives from several terrorist groups. She is teamed up with a new level 5 operative, Marco O'Brien. O'Brien was the police officer recruited four years earlier because of a mistake Nikita made, a fact that O'Brien has not forgotten. Nikita finds that besides the terrorists, she must deal with O'Brien & the hostility of much of Section personnel because of her role in Center's evaluation of Section.
Nikita est renvoyée à la Section Une pour détruire une nouvelle menace terroriste qu'elle est la seule à pouvoir gérer lors d'un sommet de représentants de groupes terroristes. Elle est associée à un agent de niveau 5, Marc O'Brien. Celui-ci était un officier de la police recruté quatre ans plus tôt, à cause d'une erreur de Nikita, ce qu'il n'a pas oublié.
Nikita viene rimandata alla Sezione Uno con l’intento di portare al successo un’ultima missione, distruggere una nuova coalizione terroristica "Il Collettivo". Il suo partner, dopo la scomparsa di Michael, diventa O’Brian, il poliziotto già visto nella prima serie e il suo rientro alla Sezione non è affatto facile visto che tutti la giudicano una “spia”. Soprattutto Operations che non crede che Michael sia morto e vuole a tutti i costi dimostrarlo per distruggere una volta per tutte Nikita.
Мэдлин больше нет. Майкла больше нет. Именно в такой ненужный момент Никита начинает делать очередные попытки, чтобы уйти из Отдела. Три года назад Мистер Джонс обещал ей свободу в замен на шпионство за Отделом с ее стороны: пришло время платить по долгам. Но как всегда случается неожиданность: Джонс просит Никиту о последнем задании перед свободой. Параллельно с этим Шеф вместе с Куинн хотят выяснить настолько ли Майкл мертв как это утверждается. Куинн рада ему помочь.
Nikita vuelve a la Sección Uno para destruir una nueva amenaza terrorista con la que sólo ella puede tratar: una reunion de representantes de diversos grupos terroristas. Se entrena con un nuevo operativo, Marco O'Brien. O'Brien era un oficial de policís recutado 4 años antes a causa de un error de Nikita, cosa que O'Brien no olvida. Nikita debe lidiar con los terroristas, O'Brien y la hostilidad de parte de la Sección.