殺されるはずのミヤコ(豊島心桜)が生きている事に驚く宮ノ森(鳴海唯)。彼女を救ったのはガスマスクを被った神崎(北山宏光)だった。琴音(玉城ティナ)を守るために神崎が歴史を変え始めていた。時間が戻った真人(南出凌嘉)はテロの光景が蘇り、琴音への憎悪を抱き始める。ビスケットルームの壊滅、次の目標は玄奘(高橋光臣)。暴走し始めた神崎の前にタイムリープをした柳(深水元基)が現れ、止めようとするが…。
