A prequel to the series. High school student Saya Toma lost her parents and younger brother in an airplane accident. Detective Akio Kondo came and told her "your family has a high possibility that they were killed by people who have spec." That was the first time she heard of "spec". 6 years later, Saya Toma, who has never forgotten what the Detective said, decides to become a detective. She returns to Japan after receiving training by the FBI in the United States. Saya Toma is assigned to work unsolved cases in the Public Security Bureau. Meanwhile, because of Satoshi Chii's (Yuu Shirota) scheme, Juichi Ninomae (Ryunosuke Kamiki) considers Saya Toma his parents' enemy and tries to push her to the edge. Satoshi Chii's scheme has also caused Saya Toma and Juichi Ninomae to forget that they are brother and sister. The siblings are headed to a life-staking fight. A girl named Maho Ueno (Umika Kawashima) becomes involved in their fight. To protect Maho Ueno, Saya Toma uses "spec".
両親と弟を飛行機事故でなくした女子高生・当麻紗綾（戸田恵梨香）のもとに警視庁弐係の・近藤（徳井優）という刑事がやってきた。
「あなたの家族はスペックを持つ者たちに殺された可能性が高い」
スペック・・・当麻が初めてその言葉を聞いた瞬間だった。
5年後、その話を片時も忘れたことのない当麻は、迷わず刑事の道を選ぶ。FBI研修を終え帰国した当麻は、公安部公安第五課未詳事件特別対策係への配属が決まり、係長の野々村（竜雷太）に出迎えられる。
一方、ニノマエ（神木隆之介）は地居（城田優）の策略により、当麻を親の敵と憎み、あらゆる手で当麻を追い詰めようとする・・・
地居によって歪められた当麻とニノマエは仲の良い姉弟だった記憶をいっさい消され、命を賭けた戦いへと向かうことに・・
そして、その渦の中に巻き込まれた一人の少女・真帆。カノジョを守るため、当麻はSPECを使うことになるのだが……
