「誕生！小さな神様」 小学5年生の四葉こころはちょっと不器用だけど、モノを大切にする女の子。ある日、こころが小さい時から大事にしている色鉛筆からモノのかみさま「ここたま」が生まれた！名前はラキたま。ここたまは人間に姿を見られたら元のモノに戻らなくてはいけないという決まりがあるのだが、ラキたまはうっかり、こころに姿を見られてしまって！？ 「こころ、家をたてる！？」 こころはラキたまと「ヒミツのけいやく」を結ぶことになった。しかし、契約書には、その日のうちにここたまの住む家を作らなくてはいけないという条件が。不器用なこころは、なんとか一生懸命ラキたまの家を作ろうとするが、どんどん時間がせまってきて・・・。
「ピアノの神様、メロリーなの♪」 こころの元へ新たなここたま・ピアノのかみさま、メロリーがやってきた。ずっとこころに会いたかったメロリーは、こころと契約を結ぼうと言いだす。しかし、一人の人間が契約できるのは1人のここたまだけ。既にラキたまと契約していることを知ったメロリーは、あまりのショックに泣き出してしまう。 「ここたまの大そうじ！」 ラキたまとメロリーは、こころを喜ばせようと、こころが学校にいっている間にお部屋の大掃除をすることに。ラキたまとメロリーはこころのお部屋をちゃんとお掃除できるかな？
「ここたま学校へ行く」 ラキたまとメロリーは、こころに内緒でランドセルに忍び込み、学校についてきてしまった！！人間に見つからないようおとなしくしているとこころと約束した2人だけど、こころが体育の授業でいなくなったすきに教室から抜け出してしまって・・・！？ 「ウサギの神さま」 学校の中を冒険するラキたまとメロリー。音楽室のピアノで遊んでいると、そこへこころのクラスメイトでオカルト好きの仁科が飛び込んできた。急いでたまごに隠れる2人。姿は見られずに済んだものの、仁科は音楽室に現れた不思議なたまごを怪しんでいる。隙をみてなんとか音楽室から逃げたけど、仁科さんが追いかけてきて大ピンチ！
新たなここたまを発見したこころ。こころは、部屋でさっそくたまごを割ってみるが、なぜか割れない。たまごの中にいるのは、本のかみさま、おシャキ。ここたまとして生まれてきたけれど、ページが１枚破られているためたまごから出られないというのだ。こころたちは、おシャキをたまごから出すために、破れたページを探し出すことに。
四葉家のテレビから生まれたここたま・ゲラチョが、ある日こころたちの前に現れた！ゲラチョは、ライバル心を抱くラキたまにお笑い対決を申し込む。その対決は、負けた方がここから出ていくというもので・・・。
遠足で山へやってきたこころたち。だけど、留守番しているはずのここたまたちが、ついてきてしまった！こころは見つかったらどうしようと気が気でない。リュックから抜け出して魔法を使ったり、ラキたまたちがクラスメイトに見つかりそうになったり、次々と事件が起こる中、ついにここたまたちは、こころとはぐれてしまう。ここたま大ピンチ！！
「セクシーここたま♡キラリス」 こころのお母さんのリップから生まれたここたま・キラリスはセクシーでちょっとわがままな女の子。メロリーの部屋を自分の部屋にすると言いだして、他のここたまたちはキラリスのわがままぶりに大激怒！ 「がんばれ！おかあさん」 お母さんが急遽、手芸教室の先生をすることになった。一生懸命教えるが、生徒の奥様たちはうまくできずにイライラ！ついに、イライラが頂点に達した奥様たちはレッスンをキャンセルすると言いだして・・・！？
ある日、四葉家の食べ物が全部なくなってしまうという事件が発生！犯人探しをすることにしたこころとラキたまたち。罠をはっていると、そこには新しいここたま・モグタンの姿が・・・！
6年生とグラウンドをかけてフットサル勝負をすることになったあやかたち。こころとここたまたちは一生懸命応援するが、試合では6年生のズルが続出！スイカが飛んできたり、コショウが飛んできたりと5年生は邪魔ばかりされて思うように試合が出来ない。ここたまは魔法で対抗しようとするが・・・。
「探せ！たませんにん」 ある日、ここたまたちがテレビを観ていると画面に「たま仙人」と名乗る人物が現れた。たませんにんは、どうやらとても偉い人らしい。明日の日没までに自分を見つけることが出来たらごほうびをあげるというたませんにんの言葉に大喜びのここたまたちは、はりきってたませんにん探しに出かける。 「勝負だ！たませんにん」 たませんにんと勝負をすることになったここたまたち。たませんにんに勝ったら、一人前のここたまだけが行ける場所「ここたま界」がどんなところか教えてくれるというのだ。それぞれ、たませんにんに勝負を挑むことになるが、はたして勝てるのか！？
こころ行きつけの駄菓子屋さんが閉店の危機！？近所に新しいおやつショップが出来て、そのお店のいじわるでお客さんが減って困っているというのだ。こころたちは、駄菓子屋にいるここたま・バン之介と一緒にお店を助けることにする。
こころが留守の間にハウスを飾りつけ、びっくりさせようと計画しているラキたまたち。しかし、どんな飾りにするか、なかなか意見がまとまらない。ついにはケンカになってしまい、ラキたまを残し、他のここたまたちは、自分が生まれたところに戻ってしまう。
「こころのドキドキクリスマス」 クラスメートのクリスマスパーティに呼ばれたこころ。プレゼント交換のプレゼントを気合を入れて用意したのに、プレゼントを忘れてきてしまっていた！ 「ここたまのハラハラクリスマス」 こころが出かけた後、プレゼントを忘れて行ったことに気付くラキたまたち。こころにプレゼントを届けるため、外に出ることを決意する。
「アワッと登場！双子のここたま」 仕事で悩みがある様子の幸一。お風呂上りを狙って、魔法で元気づけようとするラキたまたちだが、お風呂から出てきた幸一はさっきとは違って元気な様子。みんなは拍子抜けしてしまう。翌日、こころとここたまたちはお風呂掃除の最中に、新たなここたまを見つける。 「サリーヌとパリーヌの秘密」 サリーヌとパリーヌはお風呂でこっそり四葉家のお手伝いをしていた。昨日、お父さんが元気になってお風呂から出てきたのも、2人の魔法の力だという。そんな二人にはある秘密があって・・・！？
「おまたせ！あたちがミシル！！」 最近、誰かに見られていると感じているこころとここたまたち。その正体はポストから生まれたここたまミシルだった。幽霊じゃないかと怖がっていたここたまたちだったが、かわいいミシルが自分たちを見ていたと知って一安心。しかし、実はミシルには別の思惑があって・・・。 「謎のスパイ！コードネーム346」 深夜、ここたまハウスに現れた謎のスパイ コードネーム346。コードネーム346はここたまハウスに忍び込みここたまたちの知られたくないヒミツを探る。
「広がれ！ここたまハウス」 サリーヌ、パリーヌ、ミシルのために新しいここたまハウスの制作にとりかかるこころ。しかし、出来上がったハウスはヨレヨレだった。ラキたまたちはこころにお手伝いを申し出る。 「ゆうびん大追跡！」 こころはサリーヌ、パリーヌ、ミシルをつれて郵便局へ。郵便屋さんをヒミツ連絡員と思い込んだミシルは潜入捜査を開始。郵便配達のカバンに入ってついて行ってしまう。
今日も学校で思う存分遊び回るここたまたち。こころは慌ててラキたまたちを捜索する。その様子を見て、こころが何か悩んでいるのではないかと心配するひなとあやかだったが、こころに霊が取り憑いていると怪しむ仁科とともにこころをつけ回す羽目になってしまった。こころは友達に真実を告げるべきか悩み始める。
「鬼だ！豆だ！節分だ！」 お父さんの幸一がオニに扮しているのを見てびっくりするここたまたち。お父さんがオニをやっていることを知らないラキたまたちは、こころたちを守るためにオニ退治に向かう！？ 「雪にビックリ！銀世界」 朝起きてみたら外は一面の銀世界。ラキたまたちは遊びたくて仕方がない。するとそこへアマンダが現れ、ラキたまたちは偶然庭に落ちてしまう。早速遊びを開始するここたまたちだったがそこへたま仙人が現れて・・・。
バレンタインのお菓子作りをするこころとここたまガールズたち。当日、一之瀬くんの靴箱にこっそりチョコを入れたこころだけど、そのチョコにはメロリーの強力な魔法がかかっていることがわかって・・・！？
近所の公園で、新しいここたまに出会ったこころとラキたまたち。そのここたまたちは人間を嫌い、自由に生きる「ノラたまトリオ」だった。こころとラキたまたちは仲間になろうと声をかけるが、「人間と契約しているここたまとは仲間になれない」と言い、こころたちは公園を追い出されてしまう。
「お母さん、大いに怒る」 いつも仲の良い、こころの父・幸一と母・美里が急にケンカしてしまった。こころたちは何とか仲直りさせようと原因を突き止めることに。ミシルはここたまスパイ コードネーム３４６として、美里がいる部屋へ潜入を試みる。 「またまた！ノラたまトリオ」 腹ペコなノラたまトリオは、食べ物を求めて街へ出かけると、偶然駄菓子屋帰りのこころたちに出会った。お菓子をかけた勝負を挑むノラたまトリオ。しかしその勝負とは意外なもので・・・！？
3月3日のひなまつりはひなの誕生日。ひなの家で、こころ・あやかの３人はひなの誕生パーティーをすることに。豪華なひな人形に感動するこころたちだが、実は、ひなはお雛様のことがあまり好きではないという。一方ひな人形を見てはしゃぐラキたまたちの前には、たませんにんが現れて「お内裏様とお雛様が泣いている」と言いだして・・・！？
こころは偶然、クラスメイトのケイトがアイドルを目指して歌の特訓中だということを知った。オーディションに向けて特訓を始めるケイトを応援するこころ。ここたまたちも協力し発声練習やコーディネイトのアドバイスをする。しかしオーディション当日、緊張したケイトは失敗をしてしまう。落ち込むケイトを何とか励ましたいこころたちは、ある計画を練るのだった。
「おシャキ、引っ越します」 おシャキは頼られると断れない性格。いつもラキたま達に何かと頼られて、大好きな本もゆっくり読むことができない。おシャキの部屋がみんなの通り道にあるのが原因だと考えたおシャキは、こころに部屋を変えてもらおうと決心するが・・・！？ 「ひきだしのなか」 ノラたまトリオに新たなメンバー・ダシマキが加わった。机から生まれたというダシマキ。ダシマキがノラのここたまになったのにはある事情があった。
「ゲラチョの神さま修行？」 お笑いが大好きなゲラチョは、まことの部屋でいろんなものにツッコんでお笑いの修行をしていた。そこにまことが部屋に入ってきてしまい大ピンチ！！ 「アマンダと急接近！」 四葉家の飼い猫アマンダは、そっけない日もあれば、優しくしてくれることもあって、ここたまたちにとっては不思議な存在。そんな中、サリーヌは弱点を知っていると言いだして・・・？
ラキたまはこころと散歩中にうっかりカバンから転げ落ちてしまう。顔を上げたラキたまの目の前には一人の少女が・・・！ここたまは契約者以外に見られたら物に戻らないといけない。どうする！？ラキたま！！
ラキたまたちの前に現れたこころ以外のここたま契約者・のぞみ。彼女はこころと同じクラスに転校生として再び現れた！同じ契約者同士なかよくなりたいと思うこころだけど、のぞみはやることがあるからと、すぐに教室から出て行ってしまう。
「ここたまの契約更新！？」 ここたまが人間の役に立っているか審査にやってきたたま仙人。合格しなければこころと契約を解除しないといけないというが、この困難を乗りこえられるのか！？ 「スーパーはパラダイスだぐぅ！」 四葉家のみんなでスーパーに買い物へ。そこに、モグタンがこっそりついてきてしまって・・・！？
「突撃！テレポンショッピング！！」 旅をしながらここたま相手に商売をしている2人組のここたま、レンジとピンコ。旅の途中、二人はここたま契約者であるこころに出会う。 「走れアマンダ」 四葉家の猫アマンダに乗って移動していたラキたまたちは、同じようにネコに乗って移動をしているノラたまトリオと道でばったり出会い、勝負をすることに。
こころが家に届いた宅配便を開けると、そこには先日出会ったピンコとレンジが！！商売上手なピンコと職人のレンジ。実は2人ははなればなれになってしまった持ち主と生まれた家を探していて・・・！？
「ここたま、空を飛ぶ」 こどもの日に飾られる大きな鯉のぼりに興味津々なラキたまたち。さっそく近づいて調査をしていたら、そのまま鯉のぼりと一緒に空に上がってしまって・・・！？ 「母の日大作戦！」 毎日家族のために頑張ってくれている母・美里に、母の日のサプライズを準備するこころたち家族。ここたまたちも協力しながらサプライズの準備をしていたら、まだ準備が終わっていないのに美里が帰ってくる時間になってしまった！！
運動会で障害物リレーの選手になったこころ。学校の帰り道、ペアを組むクラスメイトの青山くんが特訓する姿を見かけた。一位をとりたい青山くんの気持ちを知ったこころはラキたまたちとに特訓に協力することにする。
「うらないでラッキーなの！？」 最近話題の占いをやってみたメロリー。その占いによると、陽が暮れるまでに三つのラッキーアイテムを集めないとメロリーは石になってしまうらしく・・・！？みんなでラッキーアイテムの捜索をスタート。 「こころ、ゲームの神様になる！？」 こころたちはおつかい途中に、新しくできたゲームセンターを発見した。中に入ってみると、なにやら様子がおかしくて・・・！？
「ミシル危機一髪！」 女王様になってチヤホヤされるのが夢のミシル。その夢を叶えるいい方法を思いついたミシルは、ピンコがやっているテレポン・マル秘ショッピングへ何やらお願いをしはじめて・・・。 「一之瀬君のトンでもシークレット」 最近、クラスメイトの一之瀬くんの様子がおかしい。いつも参加しているサッカーの練習も断って帰っている。こころがこっそり一之瀬くんの後をつけていくと、そこで思いがけないヒミツを目撃する！
クラスメイトのオカルト好きの仁科さんに、こころとのぞみが何かヒミツがあるのではと疑われてしまう。仁科さんから注意をそらすためにこころが思いついた作戦は、仁科さん憧れのUFOをみつけることだった。
「雨でルンルン♪ここたまハウス」 外は雨なので家でお留守番するラキたまたち。でも本当は雨の中で遊んでみたい！そこで、サリーヌ＆パリーヌの魔法でここたまハウスに雨を降らせようと試みる。 「はらぺこ！ノラたまトリオ」 今日もはらぺこのノラたまトリオ。そこへ、ちょうど買い物帰りののぞみとビビットが通りかかる。ノラたまトリオはさっそく立ちふさがり、食料をかけた勝負をビビットに仕掛けたのだが…？
「ゲラチョ、弟子をとる！？」 人気のお笑いコンビ・スカンジナビアンズの話題で盛り上がるこころたち。しかしゲラチョだけは最近の彼らはいまひとつだと思っているみたい。そんな時目の前に、スカンジナビアンズのかつての相方だったという人物が現れて…！？ 「あかねちゃんがやってきた」 まことに想いを寄せるあかねが、ばあやのフネとともに四葉家へ遊びにやってきた。まことが帰ってくるまで待っているあいだ、フネはお茶を入れるために台所へ。しかしそこにはモグタンがいて…！！
ノラたまトリオの一人・とくまるは、ある日、うっかり女の子のカバンに入ってしまいそのまま連れて帰られてしまった。連れて帰られた家で、その家に住むここたまに出会って・・・！？
遊園地「あおぞらんど」に行くことになったこころとのぞみ。ここたまたちと一緒に楽しんでいると、迷子の少年・航太と出会う。本当はお父さんと来たかったという航太のために、こころとのぞみ、ここたまたちが走り出す！
こころとのぞみは、ここたまたちが思う存分楽しめるように二人で遊園地をつくることを思いつく。２人の共同作業で、できあがるその遊園地とは！？
「図書館で勝負でございます！」 クラスのグループ発表の調べものをするために図書館にやってきたこころ。本から生まれたおシャキはたくさんの本に囲まれて大興奮！そこにはニーチエというここたまがいて・・・！？ 「ほ～っとできない保健室！？」 保健室で出会った新たなここたまホットニーは、怪我などをした子どもたちの気持ちを落ち着かせる手助けをしているという。ホットニーはここたまたちの看病をしたことがなくいつかやってみたいと憧れていたところに、ここたまたちの間で『こまっくり』という病気が流行する。
「みんなでつくろう！新メニュー」 ある日ピンコとレンジがここたまハウスにやってきた。夏の新メニューを開発することにしたのだが、いいアイディアが思いつかないという。ラキたまたちは一緒にポンポコショップの夏の新メニューを開発することにした。 「夏だ プールだ ここたまランド」 みんなで開発した夏の新メニューはここたまたちの間で大好評！そこにたませんにんがやってきて、新メニューのお代としてここたまランドに魔法をかける。すると流れるプールが現れて・・・！？
「浴衣でビッグウェーブ！」 『ゆかたオーディション』にでることになったこころのクラスメイトのケイト。その着付けをこころの母・美里がお手伝いすることになり、事務所を訪れたこころたち。しかし事務所のエアコンが壊れてしまって・・・ 「ここたま、夏祭りへ行く！」 こころとひな・あやかは、偶然出会ったのぞみと合流して夏祭りにやってきた。ラキたま達もこっそりついて来ていて、色んな屋台をまわって大ハシャギ。しかしその中の射的屋がどうやら様子がおかしくて・・・！？
おばあちゃんの家へ夏休みをつかって遊びに来たこころとまこと。島での遊びを満喫していると、時々、不思議なことが起こっている事に気づく。
不思議なことが起こっている原因は山の中にあるらしい事を知ったこころたち。みんなで調べに出かけたのだが、早々に迷子になってしまった！行く先々でおこる不思議な現象は、ここたまの魔法にどこか似ていて・・・
「ねらえ！ハッピースター」 こころと楽しい夏休みを過ごしたラキたまたち。一方のぞみとビビットは毎日ハッピースター集めをしていたらしい。それを聞いて焦るゲラチョは、負けじとヤル気をだしハッピースター集めに乗り出す。 「夏の思い出」 夏休みの自由研究のことをすっかり忘れてしまっていたこころ。ラキたまたちはこころのお手伝いをしようと、それぞれのアイディアを持ち寄るが・・・？
「ここたま活動大作戦！」 いつもはこころと一緒に学校に行きたがるラキたまたちが、今日は珍しく家に残ると言い出した。こころを見送り、いよいよラキたまたちのヒミツのここたま活動がスタート！ 「赤ちゃんここたま ニコリでにっこり」 ビビットたちはのぞみが赤ちゃんの頃から大切にしていたタオルをみつけた。そのフワフワとしたタオルが気に入ったビビットたちがお布団かわりにして寝ていると、そこから新たなたまごが生まれて…！？
９月９日はこころの誕生日！！こころに喜んでもらおうと、ラキたまたちはサプライズパーティーの準備をする。この『マル秘サプライズ９９作戦』は、ここたま史上もっとも完璧な計画だったはずなのだが・・・？
「いらっしゃい、ニコリ」 ピンコとレンジが出かける間、赤ちゃんここたま・ニコリをここたまハウスで預かることになった。ラキたま達みんなが喜んでかわいがったりあそんでいる一方で、パリーヌだけは初めての経験に不安でいっぱい・・・。 「そうだ手紙を書こう」 敬老の日に、おじいちゃん・おばあちゃんへ手紙を書こうと準備をするこころだが、一方、弟のまことは手紙を書く事を面倒臭がって適当に済まそうとしている。それを知ったミシルは怒り爆発。郵便ポストから生まれたミシルの手紙に対する想いが明らかに。
「恋の神さま？ノラたまトリオ」 こころの飼い猫アマンダに恋をしてしまった野良猫の虎太郎。アプローチをするも上手くいかない虎太郎を見かねたノラたまトリオは、恋のキューピッド作戦をしかける事にした！！ 「ばっちこい、ワイがウケローや！」 フリーマーケットに参加することになったこころ。そこでグローブのここたま・ウケローに出会う。そのウケローの生まれたグローブがフリマにだされている事に気づき心配するこころだったが、ウケローはむしろ嬉しそうで…？
学芸会でこころのクラスは『シンデレラ』をやることになった。くじ引きで主役をやることになったかえで。ケイトと一緒に特訓をして本番に挑むが、かえではどうしても緊張が抑えられない。いよいよ当日、ここたま達が力を合わせて『シンデレラ』を成功させようとサポートするが…？！
「誕生！？ミシル女王様」 ミシルは学芸会『シンデレラ」のセットで見た豪華なベッドが忘れられず、自分もほしいと言ってきかない。無いものは仕方ないとなだめるおシャキたちをよそに、「ベッドが無いなら作ればいい！」と言いだして…？ 「こころとラキたま 思い出の日」 今日は、こころとラキたまの二人で隣町へお出かけ。はじめての街並みにワクワクするラキたまだったが、途中でこころとはぐれてしまった！！見知らぬ土地で離ればなれになってしまった二人は、再会することはできるのか？！
「キラリスのおしゃれ教室」 おしゃれが大好きなキラリスは、自分だけでなく他のここたまたちにもおしゃれを楽しんでもらおうと思い、普段おしゃれにあまり関心がないというビビットをおしゃれにしようと思いつく。 「モグモグ、ピーマンツアー！」 こころのクラスメイトがピーマンを苦手なことを知ったモグタンは、ピーマン嫌いを克服させようとある作戦を思いついて・・・？！
「読書中はお静かにー」 ある日図書館に行くと、図書館に住むここたまニーチエが困っていた。借りた本をなかなか返さない男の子がいるらしく、おシャキはニーチエといっしょにその理由を探ることに。 「看板娘 メロリーなの♪」 ポンポコショップの新商品・ホット生マシュマロを食べに来たメロリーたち。みんなから大人気のメロリーに、ピンコは「ポンポコショップの看板娘になってほしい」とお願いする。
テレビでハロウィンのことを知ったラキたまたちは、自分たちもここたまハウスでハロウィンパーティーを開く事にした。のぞみやビビット、いろんなここたま達を招待し、だれが一番お客を驚かせることができるか勝負をしたラキたま達だったが…？！
「コードネームは７５３」 こころの弟・まことのクラスメイトであるあかねに、七五三のお祝いパーティーに招待されるこころとまこと。そこで、フネに元気がない事に気付いたこころは合流したのぞみ達と一緒にフネの心配事を解決しようとするが… 「バンバンダシダシ猛特訓じゃ！」 しばらくハッピースターをみていないと話すバンノ介とダシマキの前に現れたたませんにん。たませんにんは「見習いの期間が長すぎるここたまには、とても恐ろしいことが起きる」と言いだして・・・？！
「熱血！ゲラチョ先生」 いつも通り、ここたまハウスのみんなやこころを自慢のギャグで笑わせるゲラチョ。しかし、自分は「お笑いの神さま」ではなく「テレビの神さま」だと思い出して・・・？！ 「なかよし写真でハイ、チーズ！」 こころ・のぞみ・ひな・あやかは、訪れたケーキ屋さんで写真のコンテストを行っていることを知り、参加することにした。クラスメイトの男子・渡部たちも参加を宣言し、勝負するとこになって…？
「お風呂大好きさっぱりりん！」 リンスインシャンプーのここたま・サリーヌ＆パリーヌは、いつもこころが飼い猫のアマンダをお風呂に入れるのが大変そうな姿を見て、アマンダをお風呂大好きにすることを思いつく。 「画板の神様！ムッシュ・ムクンヌ」 こころたちは、ある日学校の図工室にいる画板のかみさまムッシュ・ムクンヌに出会う。いろえんぴつから生まれたラキたまは、同じ絵を描くものから生まれたムッシュ・ムクンヌと意気投合！そのままここたまハウスへ招待したのだが・・・！？
ある日突然帰ってきた、のぞみの父の勇次郎。冒険家である勇次郎が言うには、青空町の海岸に数百年前の宝物「聖なるたまご」が隠されているらしい。さっそく探しに行くという勇次郎についていくことにしたのぞみとこころ・ラキたまたちだったが・・・！？
「かぜをやっつけろ！」 こころが風邪をひいてしまった。ここたまたちは風邪をひいて弱っているこころを心配し、元気づけようと色々な看病を試みる。ナースここたまのホットニーも心配してやってきて・・・？ 「ニコリのピンチ！？走れピンコ！！」 いつものようにレンジと公園でここたま相手に商売をしていたピンコ。ふと目をはなしたすきにニコリが遠くへいってしまった！追いかけるピンコだったが、ニコリは外の道に出てどんどん遠のいてしまう。ピンコはニコリにおいつけるのか！？
「ツルツル！ここたまスケート大会」 たませんにんの魔法でここたまランドにスケートリンクが出現！ラキたまたちは初めてのスケートにおおはしゃぎ。そこへ、ノラたまたちがおやつをかけた勝負を仕掛けてきて・・・！？ 「ビビットを追え！」 こころたちは、たまたま夜に、一人で紙飛行機に乗ってどこかへでかけるビビットの姿を見かける。翌日学校でのぞみとビビットにきいてみてもあまりハッキリしない。そこでエリートここたまスパイ３４６はビビットが何かヒミツを隠してるのでは、と調査に踏み込む。
このところ、のぞみがなんとなく元気がないようにみえるのが気になったこころは、のぞみを家に招待し、パジャマパーティーを開くことにした。
ここたまランドでクリスマスパーティーをする事にしたラキたまたち。ここたまランドをクリスマス仕様に飾り付けたのしくパーティーをはじめるラキたまたちの様子を見ているノラたまトリオにはふくざつな思いがあって・・・！？
「ここたまの初夢パニック！」 お正月が明けて、みんなが楽しい『初夢』をみたという話で盛り上がる中、ラキたまはまだ『初夢』をみていないという。それなら！ということで、おシャキたちはラキたまがいい夢がみられるようにあれこれ協力するのだが…！？ 「もっちもちキラリス」 お正月以来、モグタンが用意してくれる色んなお餅のアレンジメニューに大喜びのラキたまたち。特にキラリスはとても気に入ってパクパクとたくさん食べ続けていたのだが、ある日、キラリスは自分の体に起こった衝撃の変化に気が付いてしまった！！
「たったひとつのとくべつせき」 こころがラキたまたちと一緒におでかけする時のバッグにある『とくべつせき』。眺めがサイコーなその席をかけてラキたまたちは毎日勝負をしている。ある日、パリーヌがはじめて『とくべつせき』を勝ち取ったのだが…！？ 「こころ先生のピアノレッスン♪」 ある日、こころが学校から帰ってくると誰もいないはずの家の中からピアノの音が聞こえてくることに気付く。不安に思いながら音の主を確かめると、それはこころの父・幸一だった！ある理由でピアノの練習をするという幸一のために、こころとメロリーたちここたまがお手伝いをすることにした！
最近、疲れている様子のビビットを心配するのぞみ。ある日その理由を知ったのぞみは、ビビットとケンカをしてしまう。二人を仲直りさせるため、こころとラキたまたちは数々の作戦を実行する！
「隠し味は、ここったま」 ポンポコショップをきりもりするピンコとレンジは、とある理由から「生マシュマロコンテスト」を開催することに。こころの家にあるここたまハウスに集まり、ラキたまたちそれぞれがオリジナル生マシュマロを作ったのだが…！？ 「お笑いでサッカー猛特訓！」 こころの弟・まことが何か悩んでいる様子。その理由がサッカーの試合で失敗したせいだと知ったこころは、まことと一緒にサッカーの猛特訓をすることにした。
「豆まけ！節分バトル！！」 こころから豆をもらったラキたまたちは、自分たちもここたまハウスで豆まきをすることにした。ここたまハウスを乗っ取った3人組「ここたまオニオニトリオ」との節分バトルを繰り広げる！！ 「ホッとニッコリ保健室」 レンジ・ピンコと一緒に学校の保健室を訪れたニコリ。ニコリは初めて見る保健室に興味津々。そこで、ホットニーがしばらくの間ニコリを預かることになった。２人でこっそりと保健の先生のお手伝いをしていると…！？
「アニキの恋…」 度々現れてはインチキな商売をしている２人組BBC。今度は恋が叶うという怪しいアクセサリーを売り出した！もちろんコレもインチキだったのだが、キラリスの魔法のおかげで客の恋が成就したことで、評判がひろがっていく。 「みんなでハッピー！？バレンタイン」 今まで誰にもバレンタインチョコをあげたことがないのぞみ。こころは、一緒に作って友チョコ交換をしようと提案する。メロリーたちこころの家の女の子ここたまやビビット、ピンコ、ニコリに加え、ノラたまトリオのユラノも参加してみんなでチョコ作
こころのクラスメイトでアイドルを目指しているケイトの応援でテレビ局に来たこころたち。しかし、その場のなりゆきでこころたちもテレビに出ることになってしまった！ラキたまたちもこっそりこころたちをサポートしようとするが…？！
「旅するここたま ゆっきー」 雪が降り積もったある日、ラキたまたちがここたまランドへ遊びに行くとたくさんのカマクラが作られていた。中をのぞくとそこには雪かきスコップから生まれたここたま・ゆっきーがいた！ 「ハッピーハンター？ミシル＆モグタン」 ラキたまたちがせっせとここたま活動をしている中、ここたま活動をさぼっていたミシルとモグタンは自分たちだけがハッピースターを貰えていないことに気がつく。他のみんなが一人前になったときに、2人だけ置いてかれるのでは…と不安になったミシルはある作戦を思いつく。
「ずっぱずっぱ！アレンジムクムク」 学校へポンポコショップの配達へきたレンジが出会ったのは、不思議な形をしたオブジェ。それはムッシュ・ムクンヌが作ったソファだった。 「ウサギの神さま、再び」 大そうじでウサギ小屋を担当することになったこころ。一緒に担当するひなは、ウサギ小屋で飼っているウサギが神様で、話をしたことがあるという。今日もウサギと話をしようとはりきっているひなだが、実はそのしゃべれるウサギの神さまとはウサギのフリをしたラキたまで…！？
「夕陽をつかまえろ！？」 「ホワイトデーにはバレンタインデーのお返しをしないと一生こき使われる」ととくまる・ムキテツに聞いたラキたまたち。メロリーたちへのお返しを探しに、ラキたま・ゲラチョ・モグタン・パリーヌは家を出る。果たしてラキたまたちがメロリーたちのために探しているものとは・・・！？ 「結婚指輪を探すのよん」 ホコリまみれになりながら探し物をしているキラリス。こころの母・美里がなくしてしまった結婚指輪を見つけてあげようと家中探し回っているらしい。そこで、ラキたまたちも協力してみんなで指輪を探すことにした。
とある事情から、願いが叶わなくなってしまいそうで落ち込むのぞみ。こころとラキたまたちは、のぞみのために！と、みんなで協力してビビットと一緒にハッピースターを集めることにした！
なんとしてものぞみの願いを叶えたいビビットは、ついに「禁断魔法」を使ってしまう。とても危険な魔法といわれる「禁断魔法」を使ったビビットは、絶体絶命のピンチにおちいってしまって・・・！？
ラキたまたちのおかげで、元に戻ったビビット。のぞみは、また一緒にハッピーハンター活動が再開できて嬉しいというが、そんなのぞみをみてこころはある思いを告げる。
「春のウキウキ♪ここたま活動」 久しぶりにみんなでこころと学校へ向かうラキたまたち。春は不思議と幸せな気分になれる季節。こころをもっとウキウキで幸せな気分にしようと、ラキたまたちはハリキッてここたま活動を始めるが…！？ 「ここたま、家をこわす」 ラキたまたちがココタマンごっこを楽しんでいると、うっかりここたまハウスの一部をこわしてしまった。すると、突然ブルブル時計という砂時計が現れて・・・このままではこころとのここたま契約が無くなってしまう！？
「みんなでキャンプ！」 キャンプにやってきたこころたち家族。ラキたまたちも隠れて同じくキャンプを楽しんでいると、隣のスペースにハイテンションな一家がやってくる。次々とにジョークを繰りだすその一家をみて、ゲラチョだけはだんだん不機嫌になってしまう。 「ゲラチョ修行の旅へ？」 ゲラチョは、ある日、修行の旅にでると言い出した。心配するこころたちを振りゲラチョは部屋を飛び出したのだが…！？
「映画館へいこう」 クラスメイトのひな、あやかと一緒に映画を観に来たこころ。一緒についてきたラキたまたちがスクリーンの大きさに圧倒されていると、そこに映写機からうまれたここたま・シネマルが現れた！！ 「ここたま界のヒミツ！？」 ラキたまたちがポンポコショップで買い物をしていると、そこにたま仙人が現れた。たま仙人からここたま界の話を聞いて、ますますここたま界への憧れが増す中、ゲラチョが「ここたま界のヒミツ」というＤＶＤを見つける。
こころとラキたまたちがキッズ手芸教室で出会ったのは不思議な雰囲気の女の子・ひかり。指先がとても器用なひかりにはとあるヒミツがあって…！？
ひかりとここたま契約をすることになったライチ。しかし、ライチの契約書には「(仮)」という文字があり、ライチにはなぜかここたまとしての記憶が全然なかった。そんなライチのためにラキたまたちは一緒に教えながら「ここたま活動」をするのだが…！？
ある日、一人前になったここたましか行くことができない“ここたま界”へ招待されることになったこころ達。見習いのここたまたちにとっての憧れの世界“ここたま界”に大興奮のラキたまたちだが、実は特別に招待されたのには理由があって…！？
「アマンダとここたま活動」 こころへ忘れ物を届けようとしたラキたまたちは、途中でアマンダの機嫌を損ねてしまい一度失敗してしまう。アマンダに頼らず、自分たちで何とかしようと再出発したラキたまたちにピンチが襲いかかる。 「おとまりハウスは夢いっぱいなの♪」 裁縫箱から作られたおとまりハウスで遊んでいたメロリーだが、こころの弟・まことが、母・美里の裁縫箱と勘違いして、メロリーが中にはいったままのおとまりハウスを外に持って行ってしまった・・・！
「ようこそ！ここトレハウス」 ライチとひかりは、ここたまたちの修行のお手伝いをするべくラキたまたちをここトレハウスへ招待する。せっかくだからと、バン之介やダシマキにも声をかけてみんなでトレーニングをすることにした。 「パリーヌのやさしいひととき」 一緒に暮らしているラキたまたちを見て、自分も何か趣味が欲しいとおもったパリーヌ。いろいろ試してみるがなかなか上手くいかない。そんな中、おシャキとニーチエの勧めで本を読んだパリーヌは・・・？
「キラリスＶＳ青山くん」 学校の課題でケーキ屋さんへ取材にきたこころたちは、そこでポスターのモデルを頼まれた。こころと一之瀬でモデルをやることになり、憧れの一之瀬とのポスター撮影に、こころは大あわて！ 「開催！ここたま大運動会」 ここたまランドで『ここたま運動会』を開催することにしたラキたまたち。３チームに分かれていざ始めようとした時、ノラたまトリオが現れた。
道端で倒れているここたまを見つけたラキたまとこころたち。名前はピコタ。ピコタは大事にしてくれた人へ恩返しをするために修行の旅に出たが、初めての外の世界にパニックになってしまったのだという。「だったら！」とひらめいたラキたまが案内した先は…！？
「ちちんぷいぷいイリュージョン！？」 商店街に新しくできたお店でマジックグッズを買ったひかり。さっそくこころたちに披露しようとしたが、どれもインチキなものばかりだった。怒ったひかりたちが再びお店に行くと、そこにはマジックショーをしている２人組がいて…！？ 「モグタンただいま修行中？」 ある日、モグタンが真剣に「ここトレハウスで修行がしたい」と言い出した。しかし、ここトレハウスへ来たものの、食べてばかりでいつもとあまり変わらない様子。はたしてモグタンの本当の思いとは…！？
ここトレハウスで修行をするここたまたちをいつでも手当ができるようにしたい、というナースここたま・ホットニーのため、こころとひかりは「ここたまクリニック」を作る事にした。
「気持ちさっぱり！前向きサリーヌ」 どんな時でも前向きなサリーヌは、いつもここたまたちを前向きに励ましている。そんなある日、ミシルがある大失敗をしてしまって…！？ 「あやかとウケローの野球教室」 グローブの神さま・ウケローは、自分が生まれたグローブの持ち主・翔吾の野球の練習相手を探していた。こころたちがあやかに相談し、一緒に翔吾の練習相手をすることにした。
「ピコタ、学校へ行くであります」 ラキたま、ゲラチョとはじめて学校へやってきたピコタ。初めてみるものばかりで興味津々！メモを取りながら校内をあちこち回っていると、そこで事件が発生する。 「ここたまスパイメロリーなの～」 ある日、突然エリートここたまスパイにスカウトされたメロリー。さっそく特訓を始めるが、はたしてメロリーはエリートここたまスパイになれるのか！？
「おかえり！のぞみ＆ビビット」 アメリカから帰ってきたのぞみとビビットを迎えてパーティーをするこころたち。みんなが久しぶりの再会を喜んでいる一方で、ピンコとレンジは何やら気まずい様子で…！？ 「開店！新ポンポコショップ！」 晴れて新ポンポコショップを新装開店させたピンコとレンジ。さっそく新しいお客さんと出会うため、二人は移動式になった新ポンポコショップへ乗り込み外の世界へ走り出した！
久しぶりに、青空町でハッピーハンター活動をするのぞみとビビット。こころとラキたまたちものぞみたちと一緒に活動することになった。一方、モグタンが留守番をするここたまハウスには怪しい影が…！？
「パタリーナのお掃除大作戦」 夏休みの計画をたてるこころとラキたまたち。そこへやってきたハタキのここたま・パタリーナ。ラキたまたちは、パタリーナと一緒におかたづけをすることにした。 「ここたまランドで夏祭りじゃ」 ここたまランドへやってきたライチたち。そこへやってきたたませんにんが、ここたまランド一帯を魔法でお祭り会場に変身させてくれて…！？
こころのクラスメイトでアイドルを目指しているケイトと一緒に、ステージでマジックショーをすることになったひかり。こっそり見守るライチとピコタだったが、マジックの途中で何やら様子がおかしいことに気づいて…！？
こころとのぞみたちは、夏休みを使ってこころのおばあちゃんの家に遊びに来た。久しぶりにトトトンにもあえて、ラキたまたちは大喜び！そんな中、おばあちゃん家の近くに住む歩太が、悩みを抱えていると知ったのぞみ&ビビットはハッピーハンター活動を開始する。
無人島に遊びに来たこころとのぞみたち。そこで、恐竜の化石を発見！恐竜の化石に驚くこころたちだったが、更なるオドロキに遭遇する・・・！
「ドキドキ！ヒミツのおとまり会」 こころ、のぞみ、ひかりの３人のここたま契約者が集まって、おとまり会を開く事にした。 「ニコリを追ってどこまでも」 のぞみの見送りに空港へやってきたこころたちだったが、ふと気がつくとニコリがいなくなっていた！ニコリを探そうと飛び出したレンジとピンコたちだったが…！？
ビビットの話を聞いて、相手の気持ちを考えることが大事だと知ったピコタは、どうしたらいいか悩んでいた。気分転換にと散歩に出た先で、悩む人々に出会って…？
こころの誕生日のため、ヒミツの作戦を練るラキたまたち。それぞれ思い思いの形でこころをお祝いしようとすると、ラキたまたちの想像を超える驚きの出来事が起こって・・・！？
ここトレハウスへ修行に来てもらうここたまを探すため、ポスターつくることにしたひかりたち。ラキたまやメロリーたちここたまも協力して、町中にこっそりポスターをはっていると、こころの通うひだまり小学校で見知らぬここたまに出会って…！？
「ここたま学校、開校です！」 小学校の事をたくさん知りたいというショコランシェのため、おシャキたちはここたまハウスで「ここたま学校」をひらく事にした！ 「新メンバー！？ノラたまトリオ」 実はここたまランドで遊ぶのが大好きなノラたまトリオ。今日もラキたまたちに隠れて遊ぼうとするが、そこにはニコリだけが残っていて…！？
ショコランシェは、自分が生まれたランドセルの持ち主のりのちゃんのために、ライチと一緒にひだまり小学校の地図をつくることにした。
「おでかけお風呂はたのしいな♪」 ここトレハウスにお風呂を借りにきたサリーヌとパリーヌ。ここトレハウスのお風呂は修行用のゆらゆらお風呂で入るのにいつも苦戦しているが、なんなくこなす二人をみて、ショコランシェは弟子入りを申し出る。 「クルンとすてきなワンピース」 こころとラキたまたちは、ある日、帰り道でワンピースを抱きしめて泣いている少女・かほと、かほをコッソリと見守るここたま・クルンと出会う。
「ニコリの笑顔をとりもどせ！」 いつにも増して大繁盛のポンポコショップ。商品づくりに大忙しのレンジは、思わずニコリを泣かせてしまう。 「キラリスの幸せ探し」 ある日こころは、弟のまことのクラスメイト・あかねが泣いているところに出会う。その理由を知ったキラリスは、自分が解決しようとはりきっていたのだが…？
「かべしんぶんは芸術ですネ～」 こころたちのクラスの“かべしんぶん”をゲージュツだというムッシュ・ムクンヌ。その完成を陰からみまもっていたところに、“かべしんぶん”にピンチが訪れる。 「ピコタせんぱいが、やってきた」 ここトレハウスにピコタにが遊びにやってきた！ここトレハウスの先輩であるピコタに尊敬と憧れを抱くショコランシェだったが…！？
ここたまハウスでハロウィンパーティーをすることになり、飾り付けや食べ物の準備をするラキたまたちとパタリーナ。一緒に準備をしていたのだが、ある事をきっかけにハウスにパタリーナの悲鳴が響いて…！？
「秋のスイーツクッキングだぐぅ」 手芸教室の帰りに人気のスイーツポテトを買いに来たこころとひかりたち。行列に並んでいるあいだ、待ちきれないモグタンとラキたまはこころのもとを飛び出してしまい…！？ 「負けるな！ショコランシェ！！」 大好きなりのちゃんのため、ハッピースターを集めようと町へ出たショコランシェ。頑張るもののなかなかうまくいかないショコランシェのため、ライチとひかりも協力することにした。
「テップルと壊れたオルゴール」 メロリーたちがここたまランドで遊んでいると、そこにダンスシューズのかみさま・テップルが現れた。 「はじめまして？ぼく、ダメたま」 ある時、ラキたまの魔法がことごとくうまくいかず、ラッキーどころかトラブルが続いてしまうようになってしまった。ついには「ラキたま」という名前まで変えた方が良いのでは？という話になってしまい…！？
「チェンジ！ゲラチョとニーチエ」 テレビと本、どちらが良いか互いに主張してならないゲラチョとニーチエ。それならば、と二人の役割を入れ替えて、ゲラチョは図書館に、ニーチエはこころの家にやってきたが…？ 「あの二人が解散!?」 こころたちは、いつもは現れるたびにインチキ商売を繰り広げる二人組・BBCの一人が公園にいるのを見かける。
「バンバンダシダシまた特訓！」 ついついのんびりしてしまうバン之介とダシマキ。今度こそ修行に励もうと気合を入れたところで、ノラたまトリオに出会う。 「ここトレハウスを守れ」 ここトレハウスをかけてノラたまトリオと対決することになったライチ。ひかりが一生懸命つくってくれた事を知っているライチは、並々ならぬ想いで対決の日を迎える。
「おシャキ歌います！！」 ラキたまたちみんなが大好きなアニメの主題歌を一緒に歌うため、オンチを克服すると決意したおシャキ。メロリーとともに熱血特訓をはじめるが、果たしてその結末は・・・！？ 「ここたまハウス大分解！？」 ラキたまたちが、ここたまハウスの自分たちのお部屋をこころの家の中の思い思いの場所に移動してみたら、思わぬ展開が待ち受けていて…！？
北風の吹く青空町にひとりの見知らぬここたまが現れる。どうやら何かワケありそうなそのここたま・ポカリンはピンコとレンジのお店で働く事にした。
自分の生まれたランドセルの持ち主・りのに会いに来たショコランシェ。ところが、りのは「ランドセルはもう見たくない、小学校にも行きたくない」と言う。りのと小学校に行くのが夢だったショコランシェは、どうして学校に行きたくないのか原因をつきとめることにした。
「雪ふる夜のけいやくしょ」 こころにクリスマスプレゼントを贈りたいラキたまたち。しかしアイディアがまとまらず、ライチたちの元を訪れて話しあっていると…？ 「ここたまサンタ、出動！」 みんなが寝静まった夜、外から不思議な声がすることに気付いたラキたまたち。声がする方へ向かうと、そこには雪ぞりから生まれたここたま・ベルスがいた。
「ポカリンをほめないで」 雪が降ったある日、ここたまランドに遊びに来たライチとポカリン。そこには既にラキたまたちが雪遊びをしていた。さらにそこに雪かきスコップのここたま・ゆっきーがやってきて…？ 「暴走！パタリーナVSホットニー」 風邪をひいてしまったラキたまたちは、ホットニーに診てもらうことに。張り切るホットニーに追い回されているラキたまたちを、パタリーナが目撃して・・・！？
「こたつパラダイス」 木枯らしが舞う寒い冬のある日、ラキたま・ゲラチョ・モグタン・パリーヌたちは、こころが作ってくれたこたつで温まっていた。 「マフラーのかみさまヒートン」 ノラたまトリオがすむ公園に、見知らぬここたま・ヒートンがやってきた。ユラノたちはヒートンに勝負を挑む。
「ゆけゆけゆっきー」 こころと一緒にスキー場へやってきたラキたまたち。みんな一緒にリフトに乗っていると、モグタンが雪の中に落っこちてしまった！ 「アワワとサッパリ大冒険」 リンスインシャンプーのここたま・サリーヌ＆パリーヌは、町でせっけんのここたま・アワワに出会う。大事に使われた泡はどこに向かうのか確かめにいくというアワワにサリーヌ&パリーヌもついていく事にする。
「めざせ！ミラクルマジック」 ひかりがいつものように遊歩道でマジックを披露していると、そこに青空町の町長が現れ、ひかりにある話を持ちかける。 「キラリスがんばる」 今日はこころの弟・まことの授業参観日。本当は行きたいのに仕事が休めない美里のため、キラリスたちはこっそりお手伝いをすることにした。
「ヒートンとポカリン」 ついに探していたポカリンを見つけたヒートン。しかしポカリンは怒った様子で走り去ってしまう。ヒートンがポカリンを連れ戻せれば公園からでていくと考えたノラたまトリオは、ヒートンに協力することにする。 「鬼はそとで なんでやねん？」 あるきっかけで節分の鬼が怖くなってしまったりののため、ショコランシェはこころとラキたまたちの元へやってくる。その原因に少なからず関係があるゲラチョがとった行動は…！？
「進め！ひかりとライチ」 あおぞらカーニバルでのマジックショーに向けて猛特訓をするひかり。そこに「タマゴタイマー」が現れてひかりとライチの仮契約にタイムリミットがある事が明らかになる。 「最後のバレンタイン」 想いを寄せる一之瀬が転校ときいてショックを受けるこころ。それならば最高のバレンタインには最高のチョコをプレゼントしようと、キラリスをはじめここたまみんなでハリキったが…！？
「ばっちこい！ウケロー応援団」 一之瀬から野球の試合に誘われ、舞い上がるこころ。応援の差し入れをウキウキ考えていると、そこにグローブのかみさま・ウケローが現れる。 「リズムにのって♪こころ先生」 おシャキとキラリスの粋な計らいにより、ふたりっきりで買い物にでかけたメロリーとこころ。ゴキゲンになったメロリーが歌を歌うと、保育園の遊具が動き出してしまって…！？
ポカリンをなんとか連れ帰りたいヒートン。ノラたまトリオの協力も得て、何度もポカリンに会いに行くのだが、毎回怒って逃げてしまう。その様子を見かねたこころとひかり、ラキたまたちはポカリンに帰りたくない訳を聞く事にした。
「二人のいちにんまえ伝説」 ミシルとモグタンは、ついサボってしまいがちな自分たちも、なんとかハッピースターをゲットせねばと考えていると、そこにポカリンとヒートンの見事なコンビネーションを目撃する。 「こころとひかり、試される絆」 ひかりがマジックショーにむけて、精一杯練習していると、そこに「たまごタイマー」が表れ、ひかりの仮契約の残り時間がわずかであることが判明する。
今まで以上に気合を入れマジックの練習をするひかりとライチ。こころとラキたまたち、そしてピコタやショコランシェ、ポカリンとヒートンたちの想いをのせて、ついにマジックショーの本番を迎える。
映写機のここたま・シネマルの何気ない一言がきっかけで、映画をつくることにしたラキたまたち。みんなのそれぞれのやりたい事をすべて取り入れるシネマル監督だったが、果たして出来上がった映画は…！？
ひかりとライチに契約期間をレンタルした埋め合わせとして、一週間だけこころとラキたまの契約はなかったこととなる。その間はこころはラキたまたちの事を忘れ、ラキたまたちは絶対に姿を見られてはいけない。ここたまたちのヒミツの一週間が始まる。
ラキたまたちの事を忘れてしまったままのこころ。時間以内にラキたまたちの事を自力で思い出すことが出来なければ、契約は永遠にわすれたままになるという。ひかりやライチ、町中のここたまたちの協力でなんとか思い出させようとするが…！？
仙グウェイに乗ってラキたまたちのもとに現れた一人前になったばかりのここたま・カンナ。なんと、一人前のパンツを落としてしまったという事で青空町へ探しに来たという。みんなでカンナの一人前パンツをさがせ！
突然あらわれたカンナの教育係である一人前ここたま・たまシャイン。ラキたまたちのダメダメっぷりを見かねて、カンナだけではなくラキたまたちにも修行をさせることになった。
「カンナのここトレ修行」 一人前パンツをさがし歩くカンナ。途中で出会ったひかりとライチについて家へ行くと、ここトレハウスを目にする。一人前ここたまとしてカッコいいお手本を見せようとするのだが… 「お花を咲かせよう」 今日は学校で一人前パンツを探そうと、こころについてやってきたラキたま・カンナたち。たまシャインにも急かされてしまっていたところに、花壇にうかない顔で水をやる少女に出会う。
一人前ここたまの教育係としてカンナだけでなくラキたまたちにも厳しいたまシャインに対して、見習いのラキたまたちよりもダメっぷりが目立つたま仙人。そんな二人がどちらがより優秀であるか勝負をすることにしたのだが…
「こころのたからもの」 はやく一人前パンツを見つけようと焦るカンナを、こころは気分転換に誘う。カンナが生まれた場所に似た公園へやってきて、カンナのみならいの頃の話を聞いていると…？ 「めいたんてい おシャーロック」 消えたカンナの一人前パンツが、何者かに勝手に使われていることがわかった。そこに現れたのはおシャーロックこと、名探偵になりきったおシャキ。青空町をかけめぐって犯人をさがす！
ある日、ライチがひかりとはぐれて困っているところを、通り過ぎのここたま・スーイが助けてくれる。スーイは色んなものに興味津々で、ここトレハウスを見にひかりの家に遊びに来ることになった。
「スーイとスイスイだいそうさく！」 ラキたまとライチたちは、ここたまランドで遊んでいるうちに自転車のここたま・スーイと出会う。一方おつかいに来ていたこころたちはクラスメイトの陽子が飼っているインコが逃げてしまったと聞き、みんなで一緒に探すことにした。 「輝け！キラリス」 ある日キラリスは、誰でもメロメロにできるアタシのウィンク光線が利かなくなってしまっていることに気付く。そこに現れたたまシャインにいつまでも美しくいられるための秘訣を教えてもらおうとするが…？
「魔法で大パニック！？」 ひかりたち友達と映画を観てきたこころ、その帰り道にこっそりついて来ていたラキたまたちは、こころたちを喜ばせるためにこっそり魔法を使うのだが… 「炎のノラたま公園」 あまりここたま活動もせずに自由に生きるノラたまトリオと出会ったたまシャインは、ここたまの教育係として、ノラたまトリオをたきつけるためにある芝居をうつことにした。
「お父さんは大いそがし」 こころの父・幸一は、家族みんなのお願い事を訊いてしまったら全て同じ日に重なってしまった事に気付く。そんな康一をラキたまたちここたまみんなでフォローする事にした。 「見つけた！一人前パンツ」 なくした一人前パンツを探すカンナに対し、自分も一人前ここたまであると告げるスーイ。だがカンナの話を聞くうちに少し不安になってきて…？
ここたま界へ逃げてしまったスーイを追おうとするラキたまたち。しかし、ここたま界に行くには一人前パンツが必要だった。たまシャインがいうには一つだけ方法があるとの事だが、それにはこころも大きく関わる事であった。
たまシャインからの試練をのりこえて仮の一人前パンツを手に入れたラキたまたち。こころに見守られながらここたま界へ飛び込み、スーイを探す。しかし、ここたま界は不思議で素敵なものがたくさんあって…？
やっとのことでここたま界まつりがひらかれる事になったのだが、そこでトラブルが起きてしまい、ここたま界と人間界を巻き込んでの大騒動となってしまう。そのピンチを救えるのは「モノを大切にする心を持つ者」…つまりこころだった！
カンナをここたま界へ送り出す前に、みんなで一緒にここたま活動をすることにしたラキたまたち。すると、工作が上手くできない女の子に出会う。他人事と思えないこころが話しかけると、そこで新しいここたまが生まれて…？
