ゼロツーと滅の共闘、さらに人間とヒューマギアの協力によって、アークは滅びた。しかし、アークが残した爪痕はまだ消滅してはいなかった。“人間が存在する限り、再びアークは蘇る”と信じる滅にとって、人類が滅ぼすべき敵であるということに変わりはなかった。一方、ZAIAエンタープライズ・ジャパンの社長・天津垓の元には、本国のZAIAから“新しい社長”と名乗る人物が現れる。彼の使命もまた滅を始末すること。ついに、滅率いるヒューマギアと人類の全面対決が始まろうとしていた。
Izu has a dream of Horobi becoming Ark and goes on her own to reason with him.
¡Satellite Zea, quien era conocido como la inteligencia detrás de Zero-One, ha sido tomado por el Ark después de que a Aruto le robaran su Zero-One Driver! Incluso en una situación de tanta desesperación, incluso Jin, que estaba decidido a destruir el Arca, comienza a dudar de sí mismo. Sin embargo, Aruto no se ha rendido todavía, ¡ya que está tratando de crear un nuevo tipo de Kamen Rider! Sin embargo, Kamen Rider Ark-Zero aparece de repente ante Aruto y lo hiere fatalmente.