風都を震撼させる大事件が勃発する。街にばらまかれた、AからZまでの26個の次世代ガイアメモリ。しかし、その中で“E”=エターナルのメモリだけは、凶悪なテロリスト集団「NEVER」の隊長・大道克己がいち早く手に入れていた。「NEVER」の目的は風都を占領し、支配すること。翔太郎たちは、国際特務調査機関員・マリアの協力を得て、街の危機を救うべく、行動を開始した。美しきマリアに、自分の母の面影を重ねるフィリップ――。そして始まった、残る25個のメモリの争奪戦。だがWの前に、大道克己が変身した最凶の仮面ライダーエターナルが立ち塞がる。エターナルのメモリに秘められた、恐るべき能力。ついに訪れる、仮面ライダーW最期の日!? 巨大な陰謀が渦巻く中、次々と明かされていく衝撃の事実。みんなの祈りを胸に、熱い友情の絆を武器に――Wよ、今こそ大旋風を巻き起こせ!
Set sometime between the 44th and 45th episodes, a mercenary group called NEVER lead an assault onto Futo City using T2 Gaia Memories, a series of enhanced Gaia Memories created by Foundation X based on data from the Kamen Riders. To protect their city, Shotaro Hidari and Philip are assisted by Maria S. Cranberry to uncover the secrets behind Katsumi Daido and his group of Necro-Overs as they face what would be forever known as Futo's darkest moment.