本作品はWとディケイドのそれぞれのエピソード2編＋最終エピソード1編の計3編で構成されており、『ディケイド』⇒『W』⇒『MOVIE大戦』の順で上映される。監督の田﨑は本作品の構成を「カレーライスとカツ丼が出された後に、さらにカツカレーが出されたようなもの」と評している。それぞれが1つの映画として制作されているため、東映の企業ロゴが各冒頭に計3回流される。これは2010年に公開された『仮面ライダー×仮面ライダー オーズ&ダブル feat.スカル MOVIE大戦CORE』も同様。
従来の劇場版と同様に、劇場版初登場ライダー（仮面ライダースカルと仮面ライダーキバーラ）と、劇場版限定フォーム（仮面ライダーディケイド 激情態、仮面ライダーディケイド 最強コンプリートフォーム、仮面ライダーW サイクロンサイクロン&ジョーカージョーカー）が登場する。また本作品以降、放送中の番組の主役ライダーの新フォーム（本作品では仮面ライダーW ファングジョーカー）の先行登場、テレビシリーズに先駆けて新たな仮面ライダーの登場（本作品では照井竜 / 仮面ライダーアクセル）が恒例となる。
The Rider War has re-erupted as Tsukasa now embraces his title as the "Destroyer of Worlds". He goes on a rampage as Decade and defeats Rider after Rider. However, the one to stand against him was Natsumi, who decided to gain the power of Kamen Rider Kiva-la to stop him. In the midst of their battle, Narutaki has formed a new organization, Super Shocker and plans to give birth to the ultimate life-form with the "power to surpass God", which could be his trump card for finally achieving world domination.
On the night of Christmas Eve, the Narumi Detective Office receive a strange request relating to Shotaro's former mentor, Sokichi Narumi. On the case, Shotaro's confidence is shattered following a shocking revelation regarding Sokichi. To help him regain it, Philip takes Shotaro to a certain location... the place where everything began.
