時空刑事リリーは、時空刑務所への移送中に逃亡した第一級時空犯罪者ギルガを追って、西暦2001年の東京を訪れた。偶然出会った青年・佐久間 伸の家に押しかけたリリーは、捜査を進めつつ、見るもの全てが珍しい21世紀の世界で伸と楽しい生活を送る。しかし、その楽しさが突如として破られる。