萬獏は、明晰夢能力を駆使し、国民的有名人ネムを鮮やかに救出、夢の中で難関ミッションをクリアする無敵のエージェント。 ある夜、バクは突如怪物ナイトメアに襲われる。明晰夢の中で、バクは無敵の敵と戦うが、なぜかナイトメアを倒すことができず、逃走してしまう。追い詰められたバクは、謎の人物と出会い、ゼッツドライバーとカプセムを託され、仮面ライダーゼッツへと変身する！
夢の中でなぜか逃亡犯となっていた莫（今井竜太郎）。爆弾魔のナイトメアに遭遇するとゼッツに変身するが逃げられてしまう。ある夜、突如ゼロ（声・川平慈英）に呼び出された莫は「他人の夢に潜入しナイトメアの悪夢を未然に防げ」という指令を受ける。ということは、あの爆弾魔を止めなければ…。莫の“夢主”を守るためのミッションがスタートする！
夢主は富士見刑事。 だが、富士見は本当に連続爆破事件を望んでいたのか？ 深層心理の底に眠る心の扉。 その最後の１つが開かれれば、悪夢は現実へと溢れ出してしまう！ 夢なら最強！！ ……でも現実は普通の好青年だった莫。 ゼッツとして。 エージェントとして。 本当の戦いがいま始まる。
モコは結婚式のリハーサルに潜入。新郎は裕福な家の跡取り息子、新婦の父は有力政治家。刺客は敵対勢力か、それとも…？爆破事件のような悲劇を二度と繰り返さないためにも、任務の失敗は許されない。Zギアと新たなカプセル「ウイング」を手に、モコは真のエージェントになれるのか？夢に向かって飛べ、Z！
なぜ花嫁の美雪が夢見る者なのか？現実世界で情報収集を続けるバクは、公園の大木の前に立つ美雪と接触する。美雪には、人生を変えるほどの記憶があることを知る。 夢の世界で、バクは美雪の「心の扉」を見つけ、その扉の向こうに広がる思いがけない光景を目にする。そして、再び現れたカラスの悪夢が、美雪たちを襲う！
