末日世界里,残存的人类组成一个叫“灯塔”的组织,居住在悬浮在地面的一个类似飞船的大型机械里。灯塔派出猎荒者小分队,队长叫马克,副队长叫冉冰,到地面执行任务。
猎荒者小分队回到灯塔后,受到人们的热烈欢迎。灯塔最高领袖——城主 召开会议(廷议),各部门负责人汇报了各自工作。其中光影宗教会负责人诟病猎荒者小分队伤亡过重。
灯塔最高领袖——城主决定将最高领袖位置禅让给马克,不传给自己的儿子——光影中教会负责人(黄毛),为人刻薄。马克说,其实这个城主位置,最适合人选是他的姐姐红蔻,她因为追求自由恋爱违反了三条戒令之一而遭受火刑处死。三条戒令是:基因优化,优化后的是上民;解除家庭关系;不能自由恋爱。马克还说在地面行动时遇见一位女性人类。大家都很质疑。
马克的老师——猎荒者武术指导老师——就要被发配到远行队,即老弱病残之后脱离灯塔飞船飞向远方自行毁灭。擅自使用重力体——骨骼机械的尘民2054号,偷偷喝酒并目睹两位尘民同伴染上腥荭症,一种末日病毒。毒发后去抢食上民的食物,无非就是牛奶面包等,被执法者——荷光者就地正法。2054上前阻止求情,险些也遭正法,恰巧光影宗教会负责人路过,救下,说送去光影会“净化”。
马克的老师远行前暗示他去资料室查看“灯塔”历史资料。夜里马克和副官冉冰潜到资料室偷看档案,得知灯塔飞行器原来是人类的空中监狱人类世界毁灭后这个空中监狱反而成了人类最后的避难所。
光影首领成功用美食收买尘民2054号,不知下步要他做什么不利的事针对马克。冉冰收到通知,被要求今晚去晨曦大厅配种生育。科学博士嘉利按城主命令重新启动临渊者计划。
第1话中想为老公捐献心脏的尘民再次出现,她持枪威胁马克带他去医院捐献心脏。马克不同意,她就开枪自射腹部。马克赶紧抱着她去医院,并从这件事中悟到他要为冉冰破例。
马克一行前往目的地,途中遇到很多怪物围追堵截。
到达废弃医院,分成2组行动。其中一组的一男一女,被一个类似“鸡蛋”的怪物吞噬,吸光了人类的生命源质后,它还会把“人干”拉出来。
在一个人类旧世界的医疗机器人引导下,终于找到了药物。但是遭遇刺鳗、玛娜之花(俗称红毛丹)、息壤等生命力极强的怪物,它们能起死回生,根本杀不死也杀不完。
马克小分队分成两组:叛徒2054号所在那组在废弃医院终于找到目标药物,却遭到怪兽袭击,2054号趁机杀死队友,还好没有机会害马克。马克所在的那组支援队友迎战最为强大的袭击,经历了一场艰苦卓绝、近乎绝望的战斗,所幸战斗中遇到一女两男支援,马克他们才幸免于难。战斗中马克负伤,被救回灯塔后发现背部中脊骨虫毒。
脊蛊虫试图吞噬马克的神经,结果反被马克的神经所吞噬。嘉利博士提出方案是反正马克的脊柱已断,干脆用脊蛊虫(去头)的躯干作为马克的脊柱。方案得到城主的支持(城主已获救)。手术刚结束时,马克的体征还是好好的;但没过多久,情况急转直下,最后“死亡”!对马克火化后,马克在火化炉里突然变异成为“马克龙”——像龙一样的庞然大物。叛徒2054号也转变为上民了。
马克兽化之后,无法被灯塔所容纳。冉冰决定带着兽化的马克离开灯塔。昔日的猎荒者小队为了拯救队长,不惜发起暴动来护送马克回到地面。然而,这一切终究还是悲剧。
冉冰牺牲了自己,让兽化后的马克吸收了她的生命力。马克大开杀戒,灯塔上死伤惨重。最终马克离开了灯塔,而地面上的另一股势力正准备迎接着他的到来。