銀河のとある惑星が、クロスと戦闘ギアによって文明の終焉に直面させらていた。その人類最後の一人、イクセリオンは薄れかけていた意識を振り絞ってクロスを睨み付けていた。そして、彼らは地球にやってきた。ところが、人間を助ける戦闘スーツのイクセルが選んだのは、ただの高校生である甲斐渚だった…!?
ブラック、ゴールド、シルバーと三人のイクセリオンにも助けられ、渚はなんとかイクセリオンとして最初の敵を撃退した。だが、渚の恐怖心は大きくなるばかりであった。説得のため、河合可愛が渚の高校を訪ねた。そこへクロスの魔手が襲う。逃げ惑う生徒たちが傷つけられていく。怒りが、自らの使命を渚に自覚させた…。