明鏡医科大学付属病院に検査入院していた元総理大臣・愛宕克己（山田明郷）が急死した！ 同院の病理医・藤巻達臣（反町隆史）は死因を調べるために愛宕の遺体を解剖。その矢先、検査技師・久留米穂希（波瑠）が「殺されたのかもしれません」と言い出す。なんでも、遺産相続をめぐって愛宕の愛人・安曇杏梨（倉科カナ）と揉めていた遺族が、杏梨による殺人事件ではないかと疑い、院内で騒いでいたというのだ。綿密に遺体を調べた藤巻は、右頸部に残っていた謎の黒ずみに着目。採取した液状検体から、あろうことか“未知の球菌”を発見する！ しかも不可思議なことに、球菌は採取して１時間が経過した後、藤巻の目の前で突然消滅し…!! これは院内にいる人々はおろか、やがて世界中の命を危機にさらす“殺人球菌”かもしれない――。最悪の事態を危惧した藤巻は理事長・奥野信二（坂東彌十郎）から秘密裏に許可を取り、新たな液状検体の採取に着手する。 そんな最中、院内では新たな患者の不審死が発生！ 誰かが意図的に球菌を投与したことによる連続殺人なのか!? だとすれば真犯人は誰なのか!? 絶体絶命の窮地に陥った藤巻は“とんでもない行動”に出て…！