Il ministero di spionaggio mette in pratica un operazione di attacco speciale: un doppio assalto alla Fortezza degli eroi, dall'esterno e dall'interno.
Durante una gita in piscina Tetsuya e i ragazzi vengono attaccati dal corpo dei Catloo che feriscono ad un braccio il giovane eroe ma i nemici fortunatamente vengono messi in fuga.
Tornati alla base i ragazzi apprendono la notizia che un aereo proveniente dagli Stati Uniti atterra con grvi difficoltà e molti passeggeri rimangono feriti tra cui Sayaka, la ragazza di Koji Kabuto. Shiro e Jun si recano all'ospedale dell'aeroporto per scoprire che la ragazza è fuggita in preda all'amnesia; Sayaka viene ritrovata da Boss che la conduce alla Fortezza delle Scienze dove viene assistita. Dopo alcuni strani incidenti alla base la giovane si rivela essere in reltà la Marchesa Yanus che danneggia il laboratorio e imprigiona Jun, Shiro e il dottor Kabuto. La marchesa piazza sul Brian Condor una bomba che esploderà al momento dell'aggancio con Mazinga e non appena il mostro guerriero attacca la Fortezza, Tetsuya parte immediatamente. Fortunatamente il dottore riesce ad avvertire Tetsuya che rimuove in tempo la bomba e può combattere col mostro senza remore. Le condizioni fisiche del pilota sono ancora precarie a causa del veleno presente sulle armi Catloo ma grazie all'aiuto di Venus e all'impiego del nuovo Super Razzo il nemico viene sconfitto.
「久しぶりにさやかとデートできると思ったのに、残念だな」(ボス) アメリカからの旅客機が胴体着陸をして負傷者を出した。病院に運ばれた者の中には、何と弓さやかが含まれていた。留学中の彼女がなぜ急に帰国の途についたのか、剣造にも理由はわからない。しかも事故の影響で記憶喪失になっているらしいが、剣造が精密検査をしようとすると、怪しいそぶりを見せ始める…。