Un gruppo di loschi scienziati si offre di installare nella base di Boss robot un nuovo apparecchio radar in grado di intecettare il nemico senza dover spiare i movimenti della fortezza. Il radar però crea interferenze con l'attività di rilevamento del centro ricerche. Tetsuya di reca da Boss affinchè si convinca a toglierlo e in quel mentre un mostro guerriero attacca la base scaricando decine di soldati che irrompono nella base. Gli occupandti offrono una disperata resistenza e Tetsuya riesce a decollare col Brian Condor e prendere il comando del Grande Mazinga. Il primo mostro viene sconfitto ma il secondo inabissa in grande Mazinga, il centro ricerche occupato e il personale catturato. Ma il regno di Mikenes ha dimenticato Boss Robot che trae in salvo il Grande Mazinga mentre Nuke e Mucha liberano il personale della base disinnescando le bombe tempo collocate nelle fondamenta. Boss, col suo radar disturba i movimenti del nemico e permette a Tetsuya di sconfiggere il nemico.
「へっ、情けねえ声出しやがって！ありがたく思えよ！」（ボス） グレートマジンガーに遅れを取るのはレーダーがないからだと気付いたボスに、謎の科学者集団が接触した。だが設置してもらったレーダーのせいで研究所は電波障害に。ミケーネに騙されたとボスたちが気付いた時には、すでに研究所はミケーネスたちに襲撃され、所内での白兵戦を強いられてしまう。責任を感じたボスは…。
