Garaliya, un mostro guerriero temuto anche dai soldati di Mikene viene inviato a combattere contro il Grande Mazinga. Il mostro comincia a devastare la città e anche la scuola di Shiro viene attaccata. Jun riesce a portare in salvo il piccolo e Boss cerca di occuparsi del mostro. Garaliya finge di subire, per attirare anche il Grande Mazinga che non esita ad intervenire e inizia così il combattimento. La lotta è concitata e dopo un lungo conflitto aereo, Mazinga precipita in mare, l'elemento preferito del mostro guerriero.
「ありがとう…本当にありがとう…お礼の言葉もない」(剣造) 甲児との別れに寂しさを感じているシロー。鉄也の相棒・炎ジュンは、シローを「科学要塞研究所」に引き取ることを提案し、剣造所長も快諾する。その頃ミケーネ帝国では、残忍さ故に投獄されていた戦闘獣ガラリヤに、打倒グレートマジンガーの任が下っていた。未経験の海中戦を挑まれ窮地のグレートマジンガーと鉄也は…