Batou greift Kuze an, kann von ihm aber handlungsunfähig gemacht werden. Major Kusanagi verfolgt Kuze, der jedoch nach einem kurzen Feuergefecht mit einem Boot entkommen kann. Als ihm das Einsatzteam mit dem Kipprotorflugzeug folgen will, wird dieses von einem nicht mit geflohenen Begleiter Kuzes durch einen Selbstmordanschlag in die Luft gesprengt; Ishikawa erleidet dabei schwere Kopfverletzungen. Auf dem Boot stellt Kuze fest, dass die erbeuteten Behälter gar kein Plutonium enthalten. Auch Sektion 9 kommt aufgrund der als sicher geltenden Beteiligung des Innenministeriums zu diesem Schluss, besitzt jedoch keine Beweise hierfür. Einige Zeit später wird Kuzes Boot vor Nagasaki von der Küstenwache aufgebracht. Als es in der Stadt unerwartet zu einem vollständigen Stromausfall kommt, kann Kuze die folgende Dunkelheit zur Flucht nutzen.
Much to the chagrin of Batou, Motoko, and the rest of the team, Kuze and the refugees manage to escape in one of the camouflaged boats. They are further hampered when an explosion causes heavy losses, leaving them unable to follow the fleeing boat.
Regrouping, the team decides to refocus the investigation to the events surrounding Kuze. They start a secret investigation into Sagawa Electronics, the company responsible for the nuclear material transaction, and find that Gouda was involved. Meanwhile, as the boat heads for Dejima, Kuze makes his own unsettling discovery.
Kuze a réussi à échapper à la section 9 et prend la direction de Dejima.
Curioso: il quasi-cyborg Bato ha... sangue rosso?! (ricordiamo che l'autore ha sempre rappresentato con "sangue bianco" i cyborg e le "bambole" androidi).
クゼと9課との間にある、わずかな動機の差。それは彼に包囲網を突破させ、出島へと辿りつかせる。だが人々の前に広がった光景は、第三者による意志の介在を予見させるのだった。
쿠제와 9과 사이에 존재하는 작은 동기의 차이는 그에게 포위망을 뚫고 데지마로 가는 원동력이 된다. 하지만 사람들의 눈앞에 펼쳐진 광경은 제3의 의지가 존재함을 예견했다.
Batou se enfrenta a Kuze, en un esfuerzo para que dejara de salir con el plutonio, pero Kuze desactiva batou de la pierna derecha y el brazo izquierdo en una pelea, poniendo batou fuera de servicio para que pueda escapar.