Manabu Yukawa (Masaharu Fukuyama) is invited for a presentation on Submarine Mineral Resources Development in Harigaura. He stays at an inn. Manabu meets Kyohei who came to the inn, which is run by his aunt's family, for summer vacation. The next morning, Tsukahara, who is another guest at the inn, is found dead on the bank of a port. Manabu becomes involved in the case.
きれいな海に面した玻璃ヶ浦で計画されている、海底鉱物資源の開発。その説明会に招待された物理学者・湯川学（福山雅治）は、緑岩荘という旅館を滞在先に選ぶ。そして、そこで夏休みを過ごす旅館を営む川畑夫婦（前田吟、風吹ジュン）のおい、恭平と知り合う。次の朝、堤防下の岩場で緑岩荘に宿泊していたもう一人の客・塚原の変死体が発見される。図らずも事件に直面した湯川は、旅館廃業を考えていたという川畑夫婦や、夫婦の娘で環境保護活動に奔走する成実（杏）らと塚原の思わぬ因縁を知る。
일본의 인기 작가 '히가시노 게이고'의 <갈릴레오> 시리즈 중 6번째 이야기를 영화화하였다.
小學生恭平因雙親太忙而無暇照顧，於是一個人去親戚家經營的旅館生活。他在前往玻璃浦的電車中和湯川相遇。湯川為了要出席一個在當地召開的關於海底礦物資源開發的說明會而前往玻璃浦，恭平於是向他介紹親戚所開的旅館。
當夜，在旅館住宿的除了恭平和湯川，還有一個名叫塚原正次的男人。參加了說明會的旅館女兒成實發現，儘管她從沒見過同樣有出席說明會的塚原，但對方卻對自己露出微笑。
夜深，塚原突然消失。翌日，塚原橫死的屍體在海邊被發現，縣警到現場取證，認為他是在堤壩邊失誤跌落而意外死亡的。
同時，草薙受上司多多良管理官直接委託他特命搜查此案。原來塚原是前警視廳搜查一課的警察，並且是對多多良有恩的前輩。不認為塚原是死於意外的多多良得知湯川和塚原住在同一家旅館，命草薙為聯絡人展開獨立搜查。草薙和內海於是一邊和湯川取得聯繫，一邊進行調查。通過調查，他們認為塚原被殺後，被棄屍於海邊的可能性很高。
究竟塚原為何來到玻璃浦呢？被捲入案件中的湯川為了防止「某人的人生被扭曲」，決意揭開真相。而真相的關鍵在於16年前塚原負責調查的前坐檯小姐被殺案。其背後則是旅館家族的一個不可告人的重大秘密。
