法證部高級化驗師余星柏和霍寶英在日本舉行婚禮，度過愉快時光，詎料波折橫生；重案組高級督察井浩然亦準備與譚倩雯結婚，怎料……年輕男子從天橋自殺，死在車輪下，星柏懷疑死者並非自殺。法醫科高級醫生范佩清修補遺體時有發現，星柏透過實驗，找出真相。網絡主播凌詩蕙在荒廢工廠大廈發現屍體，證據顯示死者黃樹森由天台墮下，插穿帳篷再跌在垃圾箱旁，似乎是因欠債自殺，星柏進行實驗後，卻發現疑點重重……
星柏認為天台墮樓案的案情殊不簡單，進行測試後證明他的推斷的確有可能！警方接報，貨車司機在車斗內有重要發現，與天台墮樓案有關，隨著更進一步的發現，謎團逐步解開……星柏與寶英的弟弟霍寶樂在家中的露台用天文望遠鏡觀星，鄰居苗娜娜懷疑二人偷拍自己，鬧出笑話。范佩清發現死者黃樹森生前曾被毒打，井浩然與手下亦查到不少線索。探員王靜與喬偉斌往找財務公司的老闆陳勝飛協助調查，勝飛反抗，偉斌遇襲受傷……
佩清往診所配藥，意外遇到酷似故人的醫生冼陽。國際名模苗娜娜的經理人可樂告假前赴澳門，娜娜發現自己被跟蹤，遂向星柏尋求協助，更主動往星柏住所暫避。另一方面，星柏每星期都會飛到日本，鍥而不捨為某件事而努力……有市民向警方提供航拍片段，內有重大發現，浩然等人認出片中人，經盤問後終於得知黃樹森的死亡真相……浩然、偉斌與王靜發現有賊人搶劫，遂去追捕賊人。浩然其後發現偉斌受傷，倒臥地上……
名模苗娜娜心絞痛，卻找不到所需的藥物，求助無援，幸而遇上鄰居余星柏。星柏幫她買到特定的藥，娜娜着星柏為她保守秘密。吳書婷偕兒子喬曉明搬到井浩然家暫住，浩然悉心照顧二人。一個沙井傳出惡臭，星柏等人到場調查，發現沙井內有屍體！沙井證實無沼氣後，星柏下屬方凱欣與法醫范佩清穿上保護衣，在消防員協助下游繩落井查看，發現沙井淤泥上倒插著一具頭下腳上的屍體……另一方面，佩清在公園跑步時，再次遇上冼陽……
佩清為沙井發現的死者陳偉解剖，因屍體上半身及下半身的腐爛程度相差甚遠，難以推斷死亡時間。星柏想到在法證實驗室模擬沙井的環境，並「找幫手」進行實驗……實驗得出準確的死亡時間，但死者陳偉如何進入沙井，身體卻沒有表面傷痕，仍令人費解！星柏獲寶樂幫忙，得到通往沙井的下水道平面圖，他着下屬凱欣、程朗到大明渠進行實驗，期間卻有意想不到的發現……星柏等人解開沙井藏屍案的謎團，真相令人唏噓！
星柏往日本尋人，寶英的同學大煒找到其民宿的熟客，那人表示曾見過寶英……網紅凌詩蕙接獲閨蜜楊慧冰的求救電話，趕至酒店房間，驚見床上躺著一具赤裸男屍，慧冰身上有不少傷痕。死者是富家公子周榮添，慧冰被控謀殺，她堅稱自己被下藥施暴，但種種證據顯示她似是自願跟榮添上房……書婷打算重操故業，從事珠寶設計。娜娜被前男友、大馬富家子李啟找到，李啟逼她返大馬。王靜相信慧冰沒有說謊，向程朗詢問有關迷姦藥物的資訊……
詩蕙探望慧冰，與她重組案情，及後往找俱樂部的酒保，請她為慧冰作證人。佩清為周榮添解剖，找到其真正死因。星柏化驗慧冰當日在俱樂部喝的飲品，有所發現……書婷經好友介紹，為富商馬志雲重新鑲嵌家傳寶石。浩然等人到榮添的辦公室搜證，並且翻看榮添死亡當天在大堂的監控錄像，有重要發現……有老伯在街上暈倒，佩清為他急救，此時在診所應診的冼陽接報也攜儀器趕往救人，二人合力救回老伯！
周榮添的合夥人盧永耀被發現在家中溺水死亡，但胸口出現不明瘀傷。法證部高級化驗師陶兆銘做實驗找出造成瘀傷的原因……浩然等人另有發現，懷疑榮添、永耀之死殊不簡單！警方接報一住宅單位發出惡臭，星柏等人發現屋主譚發夫婦已發脹的屍體，現場大門外被潑紅油追債，屋內發現炭爐，譚發則似是上吊身亡，懷疑因欠債而雙料自殺……星柏前赴日本，往寶英曾就讀的大學找線索，發現存放圖書館的畢業紀念冊上，有人留言罵寶英……
佩清為譚發夫婦驗屍，查證二人死因；星柏等人發現在案發單位提取到兩組不知名人士的指紋。王靜致電譚發身處外地的女兒，告之其父母的死訊，詎料……浩然等人經過一番波折，找到譚發的印傭查問，得知屋內有大量現金和一隻名貴手錶不翼而飛。佩清約浩然、星柏到酒樓喝早茶，有意讓二人與冼陽見面……警方在當舖找到譚發的手錶；星柏等人在勒死譚發的尼龍繩上有發現，證明譚發並非自殺。娜娜接連遭遇意外事故，懷疑有人對她不利……
星柏赴日本訪尋寶英大學時期的網球隊隊友，但只找到那人的丈夫。星柏向他打探有關其妻曾失蹤的事情，得知一個意想不到的消息！浩然等找到偷了譚發手錶的人，對他進行盤問。書婷無法出席陸運會，要託浩然陪曉明參賽，箇中另有原因。曉明十分失望，浩然勸書婷多花時間陪伴曉明，書婷設法修補母子關係。在星柏幫忙下，大大縮窄疑兇的範圍；浩然、王靜回到譚發的單位，竟有重大發現，從而找到更多線索……譚發的死終於水落石出！
譚發的女兒終於回港，浩然等向她道出譚發夫婦的死亡真相，怎料……佩清的恩師邱浩基突然離世，佩清介紹他當護士的女兒邱潔瑩到冼陽的診所工作。書婷因兒子曉明的緣故，決定向富豪馬夫人揭穿其孫馬志雲的秘密！有人蓄意駕車撞向李啟，事敗後逃去，有不少憑證顯示似是其前女友苗娜娜所為，浩然等往找娜娜協助調查……佩清發現浩基的死因有可疑，調查後有重大發現！入住精神病院多年的殺人犯焦大衛，經醫生評估允許出院卻遭遇阻滯……
多年前在幼稚園無差別殺人的焦大衛，在不少反對聲音下出院；星柏因某些緣故，一直關注其動向。後來，發生一宗街頭隨機斬人案，釀成三人死亡，死者竟包括大衛！星柏等人到現場搜證，發現應屬於兇手的血跡，眾人再在實驗室重組案發經過。浩然等人查到死者方耀海與大衛之恩怨，但卻發現另一死者李樹權跟二人根本毫無關聯！佩清為三名死者驗屍，有不少發現……浩然、王靜往找本案的傷者、李樹權的太太莊少珊查問，得知案發經過……
佩清驗屍後推測出斬人案兇手使用的兇器，星柏等則在兇手的血液樣本中有重要發現。浩然等人憑著這些線索，找到一名疑兇！另一方面，佩清鍥而不捨調查恩師邱浩基之死的真相，找醫院的護士長查問……斬人案疑兇的前女友、花店老闆彭倩玟突然失蹤，浩然等接報到其花店搜查，發現有可疑，遂找星柏等到現場搜證。浩然等翻查大廈停車場的監控錄像，發現一輛貨車，司機形跡可疑。浩然等及後找到貨車，在車上尋獲線索……
星柏在日本輾轉找到寶英大學時期的好友村上雅美，希望能找到有關寶英失蹤的線索，雅美提到自己曾遭一個戴面具的人綁架，事件竟與寶英有關……星柏等人憑一些蛛絲馬跡，終在失蹤者彭倩玟的花店有新發現……浩然等還找到監控錄像中形跡可疑的貨車司機，那司機被捕後保持緘默。不少證據證明那司機曾到過花店，星柏、佩清卻認為案情仍存著甚多疑點。浩然等找上司機的妹妹協助調查，怎料竟發現意想不到的線索，逐步揭開真相！
大馬富商李王愛蓮利誘其子李啟的前女友苗娜娜答應她的要求，雙方最終不歡而散。愛蓮長女李玥提出可替她解決此事，愛蓮表示若事成考慮選她作繼承人。書婷奪得珠寶設計比賽的大獎，浩然、曉明為她慶祝，三人樂也融融。娜娜拍攝廣告時，水晶吊燈突然掉下造成致命事故！浩然、星柏等先後到現場調查及搜證，有不少發現……種種憑據顯示吊燈跌下是人為所致，現場的監控錄像還拍到兩個與廣告無關的可疑人物，包括一名車房技工及李啟……
浩然等找到吊燈下墜殺人案的兇手，但那人只是收錢辦事，背後還有幕後主謀。浩然的下屬朱洛言、張耀昌往找另一位可能涉案的工作人員協助調查，卻遭遇阻滯……娜娜欲找李啟的母親李王愛蓮理論，遭李啟阻止，她及後分別找星柏、寶樂幫忙，設法向愛蓮「反擊」，希望逼使愛蓮知難而退，不再騷擾她！某處後巷發現一具男屍，死者背上插有數十支針筒，呈十字架形狀，浩然、星柏及佩清展開調查……另一方面，冼陽在診所遭人襲擊……
針筒殺人案真相曝光，令人唏噓！遊戲影視公司「Z網絡」的遊戲設計師藍茵遇車禍身亡，星柏發現現場找不到煞車痕，車上的行車記錄儀遭人移除。浩然等查到死者死前收到「Z網絡」董事會主席林嘉琪之來電，二人正為一宗侵權案打官司。寶樂與藍茵認識，認為車禍有可疑，託星柏調查。星柏等人驗出藍茵體內有某種藥物成分，還在車禍現場有重要發現！佩清在網上遭人抹黑，打算置之不理。浩然往找嘉琪協助調查後，嘉琪竟突然失蹤……
浩然等接報得知「Z網絡」的董事會主席林嘉琪失蹤，推斷她遭人綁架。眾人輾轉找到載走嘉琪的車，經化驗後有發現。根據星柏的化驗報告，浩然等找到線索，設法查出藏參地點，成功救人並抓到犯人！佩清替嘉琪驗傷，發現她對光十分敏感，似患上恐光症。「Z網絡」的CEO王有為與法務代表黎宗廷商量，欲取代嘉琪的主席之位……佩清找精神科醫生華悅生幫忙，幫嘉琪設法克服恐光症。「Z網絡」上市，有為在上市酒會上突然昏倒……
「Z網絡」的CEO王有為突然猝死，佩清驗屍發現死者似有服用抗凝血劑，但死者並沒有相關病史。星柏等檢驗有為的血液，的確驗出有過量抗凝血劑，成份卻有可疑！浩然、星柏等往有為的住所調查，有重要發現……書婷獲著名珠寶公司聘請赴巴黎工作，浩然着她宜詳加考慮。星柏推斷藍茵發生車禍時，現場還有另一輛車，那車是導致車禍的原因。浩然等找到那輛車，循著線索查出真相！佩清遭人惡意中傷，更被張貼街招抹黑，事態嚴重……
日本警方抓到曾綁架寶英好友山口結子的犯人，在其家中發現一具女屍……冼陽與前妻安依霖關係惡劣，佩清避見冼陽。武術指導梁忠泰在屋頂綵排時，不慎墮樓身亡。浩然、星柏等展開調查……寶樂設計了一個詛咒人的應用程式，詛咒名單中已有四人死去，忠泰亦是其一，眾人死狀與詛咒吻合。寶樂認為絕非巧合，託星柏找出幕後黑手，他更不理合作夥伴愛麗絲反對，堅持關閉程式。浩然等著手調查程式中其他被「詛咒」的死亡事件……
寶樂與合作夥伴愛麗絲相約見面，竟有人想殺寶樂……星柏向浩然等提供線索，提到寶樂之前與愛麗絲溝通，發現對方會用一些特別術語。王靜翻看幾宗意外事故現場的監控錄像，亦有發現，浩然等鎖定目標人物……冼陽往找佩清解釋，指其前妻安依霖有精神病，自己亦被她刺傷，他還向佩清表白心意，佩清卻沒正面回應他。李啟往找娜娜要求復合，稱已提出與家人斷絕關係，娜娜卻堅拒復合。後來，浩然等接報，發現李啟陳屍娜娜的車內……
李啟被殺，星柏帶浩然等往娜娜家中查看，娜娜似帶走了貴重財物，不知所蹤。程朗檢驗娜娜車內搜到的證物，找到一根可疑頭髮；佩清為李啟驗屍，在屍體的手上有所發現。佩清往找冼陽的前妻安依霖澄清誤會，怎料……寶樂擔心娜娜遭人綁架，用非常手段偵查，發現案發時附近屋苑有一輛可疑車輛，星柏通知浩然等循線索追查，真相逐漸浮現！寶樂繼續查找娜娜的下落，再有發現……佩清決定跟冼陽斷絕來往，後來在停車場遭黑衣人襲擊受傷……
佩清遇襲後出現異常狀況，工作亦受影響。冼陽往找佩清，遭佩清拒愛，二人發生糾纏受傷，冼陽終讓佩清離去。翌日，冼陽被發現伏屍家中，佩清竟成為疑兇，她記不起案發時去過哪裡，面對各種不利證據……星柏要幫佩清洗脫嫌疑，與隊員不眠不休化驗現場蒐集回來的證物，找到不尋常的物質！冼陽的前妻安依霖不知所蹤，浩然、星柏等往她經營的串燒店調查，有驚人發現……浩然等在依霖的手機內找到一段影片，怎料內容卻對佩清不利……
(大結局)日本警員服部研一郎通知星拍，指報案中心曾收到寶英的求救電話。根據種種線索，日本警方終於找到寶英所在的地點。星柏與研一郎等進入地下室，找到一個大鐵籠，卻不見寶英！星柏、研一郎及後找到線索，循著線索找至一座森林，星柏急於追尋寶英的下落，不顧危險闖進森林，研一郎追至欲阻止，此時有人向二人迎面走來，那人手持一把染了血的利刀……另一方面，浩然致電書婷，書婷提到她對赴巴黎工作之事已有決定……